237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0034 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  100 
 
 		 438 aa  887    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1046  extracellular solute-binding protein family 1  40.09 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1283  extracellular solute-binding lipoprotein, putative  34.4 
 
 		 436 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1043  extracellular solute-binding protein family 1  35.62 
 
 		 435 aa  243  6e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.96 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.22 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  31.36 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  31.76 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  28.57 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  32.86 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.28 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  32.41 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.55 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.37 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 		 424 aa  56.6  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 422 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3157  extracellular solute-binding protein family 1  32.41 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0206164  normal  0.300299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.96 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.44 
 
 		 441 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.85 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0192  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.25123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.25 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 432 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  20.35 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.32 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.97 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 435 aa  53.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 		 428 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 424 aa  53.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  29.2 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  25.93 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.36 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  31.2 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 432 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6548  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.85 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  21.97 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4188  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 428 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 467 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 418 aa  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 495 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 450 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 428 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>