53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0032 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0032  group B streptococcal surface immunogenic protein  100 
 
 
434 aa  865  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  47.86 
 
 
499 aa  119  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2434  hypothetical protein  37.29 
 
 
324 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.259817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2764  hypothetical protein  38.14 
 
 
294 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27870  hypothetical protein  37.41 
 
 
227 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.86582  normal  0.0220968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2500  hypothetical protein  40.62 
 
 
339 aa  85.5  2e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7968  hypothetical protein  39.18 
 
 
303 aa  85.1  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2527  hypothetical protein  29.8 
 
 
340 aa  85.5  2e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0305  hypothetical protein  34.45 
 
 
317 aa  84.7  3e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2375  surface antigen  42.35 
 
 
291 aa  84  4e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7309  hypothetical protein  37.37 
 
 
324 aa  79.7  8e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0294  hypothetical protein  33.06 
 
 
322 aa  77.4  5e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0656  chromosome segregation ATPases-like protein  35.1 
 
 
526 aa  77  6e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0611009  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2368  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.02 
 
 
288 aa  76.3  1e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.238108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0930  hypothetical protein  31.01 
 
 
357 aa  70.1  7e-11  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1943  hypothetical protein  38.55 
 
 
289 aa  70.1  8e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.762706  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2244  peptidase M23B  30.06 
 
 
1048 aa  67.8  3e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2082  hypothetical protein  39.18 
 
 
364 aa  68.2  3e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0263451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3631  hypothetical protein  28.57 
 
 
336 aa  65.1  3e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0804  hypothetical protein  34.09 
 
 
349 aa  63.2  1e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5946  hypothetical protein  37.8 
 
 
437 aa  62.8  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20698  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5544  hypothetical protein  37.8 
 
 
437 aa  62.8  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0727339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2948  hypothetical protein  38.1 
 
 
251 aa  59.7  1e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0441  hypothetical protein  29.41 
 
 
333 aa  59.7  1e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2904  hypothetical protein  38.1 
 
 
251 aa  59.7  1e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3457  hypothetical protein  32.77 
 
 
220 aa  59.3  1e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102904  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2934  hypothetical protein  38.1 
 
 
251 aa  59.7  1e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4018  hypothetical protein  27.97 
 
 
331 aa  57.4  5e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0370  hypothetical protein  30.3 
 
 
335 aa  54.7  3e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3215  hypothetical protein  34.15 
 
 
216 aa  54.3  4e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11745  hypothetical protein  35.37 
 
 
256 aa  53.1  1e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409869 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5545  hypothetical protein  29.91 
 
 
171 aa  52.8  1e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.092464 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5947  hypothetical protein  29.91 
 
 
171 aa  52.8  1e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264862  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3632  hypothetical protein  29.59 
 
 
347 aa  52  2e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.960299  hitchhiker  0.000777335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1132  hypothetical protein  32.35 
 
 
300 aa  51.6  3e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0290503 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  33.7 
 
 
682 aa  51.6  3e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1133  hypothetical protein  36.63 
 
 
358 aa  50.8  5e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0531  hypothetical protein  29.81 
 
 
338 aa  50.4  6e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202558  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0443  hypothetical protein  28.85 
 
 
366 aa  50.1  8e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  52.27 
 
 
390 aa  47.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1602  peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  3.2696e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  51.11 
 
 
277 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  27.52 
 
 
256 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  43.48 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1312  peptidoglycan-binding LysM  45.07 
 
 
235 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0540  hypothetical protein  28.69 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  27.11 
 
 
656 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0734  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000182503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5734  hypothetical protein  26.5 
 
 
365 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  35.42 
 
 
175 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5924  hypothetical protein  29.27 
 
 
370 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  33.33 
 
 
298 aa  43.5  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0505  hypothetical protein  28.45 
 
 
364 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>