More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0025 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.6 
 
 
1251 aa  1106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  100 
 
 
1241 aa  2542  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.21 
 
 
1256 aa  1150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.23 
 
 
1243 aa  1142  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  50.8 
 
 
1244 aa  1253  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.07 
 
 
1236 aa  1159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.1 
 
 
1254 aa  1101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  47.91 
 
 
1231 aa  1136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.77 
 
 
1256 aa  1162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.04 
 
 
1631 aa  968  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.32 
 
 
1238 aa  1139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.7 
 
 
1251 aa  1079  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  48.33 
 
 
1244 aa  1145  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.09 
 
 
1284 aa  1155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.52 
 
 
1252 aa  1114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.52 
 
 
1266 aa  1144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.91 
 
 
1266 aa  1140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  47.22 
 
 
1293 aa  1157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  88.24 
 
 
1241 aa  2248  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2372  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.93 
 
 
962 aa  310  1e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0361  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.76 
 
 
953 aa  284  7e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00613542  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1170  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.96 
 
 
947 aa  280  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0379  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.74 
 
 
953 aa  279  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0620  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.75 
 
 
945 aa  272  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.14 
 
 
953 aa  269  3e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0779511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  29.48 
 
 
985 aa  267  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.64 
 
 
966 aa  261  5e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.96 
 
 
959 aa  259  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.384894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1795  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.71 
 
 
981 aa  255  4e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0956476  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.55 
 
 
973 aa  236  2e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.13 
 
 
979 aa  234  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.521268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3013  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.29 
 
 
993 aa  225  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0472  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.3 
 
 
982 aa  221  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.311423  normal  0.43995 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1279  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.08 
 
 
766 aa  219  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2484  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.85 
 
 
1004 aa  215  4e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1061  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.54 
 
 
979 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.726589  normal  0.0660038 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.97 
 
 
989 aa  212  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.783256  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2699  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.86 
 
 
996 aa  209  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0772  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.04 
 
 
989 aa  207  9e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1913  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.31 
 
 
999 aa  207  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1496  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.73 
 
 
989 aa  207  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.27 
 
 
996 aa  206  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.32 
 
 
1299 aa  206  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.07 
 
 
996 aa  206  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.27 
 
 
768 aa  204  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.137299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2066  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.1 
 
 
996 aa  202  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.4 
 
 
1234 aa  202  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.74 
 
 
1217 aa  201  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0913  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II domain-containing protein  26.52 
 
 
1032 aa  201  8e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.294336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1889  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  27.01 
 
 
996 aa  200  2e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.97 
 
 
993 aa  199  2e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2331  AIR synthase related protein  26.85 
 
 
996 aa  199  4e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.87 
 
 
1297 aa  198  5e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.49 
 
 
1301 aa  198  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.59 
 
 
1293 aa  196  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II, putative  25.45 
 
 
996 aa  195  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.494383  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0658  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.33 
 
 
1004 aa  194  6e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.32 
 
 
1313 aa  194  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.55 
 
 
1293 aa  193  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0206  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.13 
 
 
993 aa  191  6e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1280  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25 
 
 
1222 aa  191  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.52 
 
 
1297 aa  191  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2973  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.86 
 
 
1222 aa  191  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3191  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.19 
 
 
993 aa  191  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.93 
 
 
1293 aa  190  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2943  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.56 
 
 
1295 aa  189  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2831  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.56 
 
 
1295 aa  189  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2768  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.56 
 
 
1295 aa  189  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2411  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.66 
 
 
995 aa  189  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.5 
 
 
1283 aa  188  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1988  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.5 
 
 
1283 aa  188  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2727  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.56 
 
 
1295 aa  188  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.32 
 
 
1299 aa  187  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2808  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.41 
 
 
1295 aa  187  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1501  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.24 
 
 
1291 aa  187  1e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.85 
 
 
1298 aa  187  1e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.2 
 
 
1293 aa  187  1e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.94 
 
 
1298 aa  186  2e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1478  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.83 
 
 
1290 aa  187  2e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.704135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.59 
 
 
1298 aa  185  4e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.46 
 
 
1295 aa  183  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1328  phosphoribosylformylglycinamidine synthase glutamine amidotransferase subunit  25.03 
 
 
1020 aa  183  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.94 
 
 
1298 aa  183  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1111  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.02 
 
 
1295 aa  183  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.503937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3792  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.46 
 
 
1295 aa  183  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.753577  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2922  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.36 
 
 
1295 aa  183  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0116  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.75 
 
 
1221 aa  182  3e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.722762  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0351  putative phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.77 
 
 
1007 aa  182  4e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  29.71 
 
 
765 aa  182  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.96 
 
 
1295 aa  182  5e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.02 
 
 
1295 aa  182  5e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2842  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.23 
 
 
1295 aa  182  5e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1078  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  23.66 
 
 
1299 aa  181  6e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528102  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2196  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.33 
 
 
1299 aa  181  6e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0353893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.07 
 
 
1293 aa  181  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  26.12 
 
 
1295 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0498  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.85 
 
 
1295 aa  180  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  25.21 
 
 
1295 aa  180  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.61 
 
 
1293 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  24.11 
 
 
1297 aa  180  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>