77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0020 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  100 
 
 
253 aa  519  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  64.82 
 
 
257 aa  366  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  58.96 
 
 
251 aa  315  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  39.43 
 
 
261 aa  193  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  33.33 
 
 
259 aa  145  9e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  30.77 
 
 
258 aa  132  4e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  31.95 
 
 
248 aa  128  7e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  29.51 
 
 
250 aa  127  2e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  32.65 
 
 
263 aa  127  2e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  31.12 
 
 
248 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  31.12 
 
 
248 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.35932e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  31.12 
 
 
248 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.32421e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  30.96 
 
 
262 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  31.12 
 
 
248 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  31.12 
 
 
248 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.24167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  31.12 
 
 
248 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  31.12 
 
 
248 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  30.29 
 
 
248 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  30.71 
 
 
248 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  30.71 
 
 
248 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  28.92 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  2.64775e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  21.95 
 
 
267 aa  80.5  2e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  24.18 
 
 
253 aa  78.2  1e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  26.98 
 
 
244 aa  76.3  4e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.68327e-09  decreased coverage  8.87022e-08 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  24.29 
 
 
256 aa  76.3  5e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 
248 aa  70.9  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 
248 aa  70.9  2e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  25.3 
 
 
246 aa  68.2  1e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  25 
 
 
250 aa  66.2  5e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  25.49 
 
 
251 aa  65.1  1e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  32.69 
 
 
225 aa  64.3  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  32.69 
 
 
225 aa  64.3  2e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  28.19 
 
 
243 aa  62.8  6e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  28.33 
 
 
244 aa  62.4  7e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.61393e-09  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 
244 aa  61.6  1e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.57171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  23.83 
 
 
250 aa  60.8  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  22.58 
 
 
249 aa  60.5  2e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  27.89 
 
 
257 aa  59.7  4e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 
254 aa  58.9  7e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  23.46 
 
 
254 aa  58.9  8e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  26.03 
 
 
209 aa  55.5  8e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  25 
 
 
258 aa  55.5  9e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  20.52 
 
 
254 aa  54.3  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  26.7 
 
 
244 aa  54.3  2e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  6.28388e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  26.88 
 
 
240 aa  53.5  3e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  26.23 
 
 
251 aa  53.1  4e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  24 
 
 
253 aa  52  8e-06  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  31.9 
 
 
238 aa  51.6  1e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  23.42 
 
 
262 aa  50.8  2e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  23.91 
 
 
250 aa  49.3  5e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  24 
 
 
262 aa  49.3  6e-05  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  23.68 
 
 
253 aa  49.3  6e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 
246 aa  48.5  9e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  23.6 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  21.29 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  22.73 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  23.86 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  23.2 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  25.83 
 
 
237 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  27.21 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  26.71 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  27.89 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.948e-11 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  22.16 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  22.22 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  23.6 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  22.36 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  5.58246e-09  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  25.42 
 
 
273 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  21.51 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.73379e-07 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  26.28 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2156  DNA repair protein RecO  21.37 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  24.42 
 
 
283 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0642  DNA repair protein RecO  24.39 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  23.44 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  23.33 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  22.88 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  23.7 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  22.6 
 
 
263 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>