73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0017 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  100 
 
 
447 aa  881  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  53.71 
 
 
455 aa  415  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  62.16 
 
 
499 aa  193  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  54.17 
 
 
169 aa  129  1e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C65  surface antigen  28.87 
 
 
434 aa  127  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  35.48 
 
 
446 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  37.75 
 
 
279 aa  79  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  37.75 
 
 
279 aa  79  2e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  53.66 
 
 
397 aa  77.4  5e-13  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  27.43 
 
 
432 aa  77  7e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  29.25 
 
 
448 aa  76.6  9e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  45.65 
 
 
157 aa  72.4  2e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  38.05 
 
 
266 aa  71.6  2e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  45.88 
 
 
143 aa  65.1  2e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  45.88 
 
 
143 aa  65.1  2e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  38.78 
 
 
324 aa  65.5  2e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  41.24 
 
 
143 aa  62  2e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0398  CHAP domain protein  31.25 
 
 
381 aa  62  2e-08  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  39 
 
 
266 aa  61.6  3e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  39.56 
 
 
390 aa  60.8  5e-08  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  32.43 
 
 
156 aa  59.7  1e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.15 
 
 
619 aa  58.5  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.15 
 
 
619 aa  58.5  2e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0939  surface antigen  34.19 
 
 
449 aa  58.9  2e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.893795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.78 
 
 
655 aa  57.8  4e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  37 
 
 
265 aa  57.8  4e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  37 
 
 
265 aa  57.8  4e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  36.36 
 
 
512 aa  57  7e-07  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1070  CHAP domain protein  34.78 
 
 
468 aa  57  8e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.518455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  26.29 
 
 
473 aa  55.5  2e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.38 
 
 
574 aa  55.5  2e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  23.92 
 
 
476 aa  55.1  3e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.46181e-07  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  33.33 
 
 
933 aa  54.3  4e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  31.07 
 
 
300 aa  54.3  5e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  31.07 
 
 
300 aa  54.3  5e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  25.39 
 
 
436 aa  52.8  1e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  25.39 
 
 
436 aa  52.8  1e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  31.86 
 
 
318 aa  52.8  1e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  25.39 
 
 
436 aa  52.8  1e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21595e-13 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  25.35 
 
 
409 aa  52  2e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.96287e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1814  Lytic Transglycosylase  39.08 
 
 
482 aa  51.2  3e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  26.69 
 
 
440 aa  50.8  5e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  26.69 
 
 
440 aa  50.8  5e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  25.11 
 
 
448 aa  50.8  5e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  24.68 
 
 
432 aa  50.4  6e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  23.93 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2642  CHAP domain-containing protein  39.42 
 
 
255 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0716  hypothetical protein  25.37 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.663265  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  23.31 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2588  CHAP domain-containing protein  39.42 
 
 
255 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  26.25 
 
 
513 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0752  hypothetical protein  26.1 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4620  hypothetical protein  25.37 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0599  3D domain-containing protein  26.52 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  24.86 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0812  hypothetical protein  26.1 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.791616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0740  hypothetical protein  26.1 
 
 
424 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28558e-13 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  47.46 
 
 
302 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  39.42 
 
 
267 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  39.42 
 
 
267 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0685  hypothetical protein  26.1 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00231685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0651  hypothetical protein  26.1 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0595  hypothetical protein  26.1 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  27.67 
 
 
485 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0596  hypothetical protein  26.1 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  38.05 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  38.05 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2696  CHAP  33.03 
 
 
222 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0574  3D domain-containing protein  26.41 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4284  CHAP domain-containing protein  46.97 
 
 
360 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.838801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2136  secretory antigen precursor SsaA  42.22 
 
 
257 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1880  secretory antigen precursor SsaA  42.22 
 
 
257 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2380  CHAP domain containing protein  34.94 
 
 
582 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>