More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0016 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  53.52 
 
 
633 aa  685  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.48 
 
 
702 aa  736  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0072472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.66 
 
 
632 aa  706  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.18 
 
 
697 aa  673  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.68 
 
 
633 aa  686  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  54.44 
 
 
633 aa  685  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 
602 aa  639  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  53.52 
 
 
633 aa  685  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0014  cell division protein  74.73 
 
 
655 aa  972  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0404  ATP-dependent Zn protease  59.2 
 
 
700 aa  689  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.083977  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  60.9 
 
 
708 aa  759  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0188  ATP-dependent Zn protease  60.51 
 
 
734 aa  687  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0018  FtsH-2 peptidase  60.94 
 
 
695 aa  768  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  54.44 
 
 
633 aa  685  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  54.44 
 
 
633 aa  685  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  54.44 
 
 
633 aa  685  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  54.44 
 
 
633 aa  685  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  54.68 
 
 
700 aa  678  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  54.44 
 
 
633 aa  685  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  54.76 
 
 
633 aa  689  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.04 
 
 
639 aa  697  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.46 
 
 
635 aa  710  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.23168e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0016  cell division protein FtsH  100 
 
 
658 aa  1338  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.18 
 
 
697 aa  673  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
611 aa  618  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.70708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  48.82 
 
 
638 aa  605  1e-172  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.33 
 
 
639 aa  605  1e-172  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.04 
 
 
643 aa  603  1e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.52 
 
 
637 aa  602  1e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.91 
 
 
615 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.45 
 
 
630 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.19838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  48.87 
 
 
614 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.68 
 
 
601 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  50 
 
 
693 aa  590  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.77 
 
 
650 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  49.68 
 
 
681 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.73 
 
 
631 aa  588  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  3.94436e-08  unclonable  2.72669e-07 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.61 
 
 
647 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.45 
 
 
660 aa  585  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.52 
 
 
638 aa  586  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.07 
 
 
620 aa  585  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.6 
 
 
640 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
601 aa  588  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  46.81 
 
 
639 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  48.5 
 
 
608 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.86964e-12  hitchhiker  9.19555e-11 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  46.29 
 
 
658 aa  582  1e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.77 
 
 
645 aa  582  1e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.33 
 
 
628 aa  583  1e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  47.72 
 
 
628 aa  585  1e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.04 
 
 
644 aa  582  1e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.48 
 
 
628 aa  585  1e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.8 
 
 
640 aa  582  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  45.87 
 
 
659 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.36506e-06  decreased coverage  4.2164e-05 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  48.96 
 
 
645 aa  581  1e-164  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.83 
 
 
657 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.96667e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
645 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  46.13 
 
 
641 aa  582  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  46.29 
 
 
639 aa  579  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.93 
 
 
599 aa  578  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.12 
 
 
652 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 
612 aa  579  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
621 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  3.90574e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.68 
 
 
636 aa  579  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.11 
 
 
653 aa  579  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  59.88 
 
 
682 aa  579  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.29 
 
 
639 aa  579  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.28 
 
 
612 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.74 
 
 
660 aa  581  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.82706e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  47.68 
 
 
651 aa  576  1e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  7.21667e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.06 
 
 
640 aa  575  1e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.9 
 
 
657 aa  578  1e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.20805e-05  hitchhiker  6.81699e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.18 
 
 
659 aa  578  1e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  2.08375e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.19 
 
 
643 aa  577  1e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.81 
 
 
634 aa  575  1e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.31 
 
 
640 aa  575  1e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.34 
 
 
607 aa  575  1e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.25 
 
 
648 aa  576  1e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.86 
 
 
655 aa  577  1e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.17945e-06  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  48.39 
 
 
650 aa  573  1e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.06538e-06  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  48.65 
 
 
627 aa  575  1e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.81 
 
 
638 aa  572  1e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  46.65 
 
 
641 aa  573  1e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  8.45189e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 
621 aa  574  1e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
608 aa  572  1e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.51 
 
 
621 aa  574  1e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.28 
 
 
657 aa  572  1e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.80208e-07  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  47.26 
 
 
647 aa  572  1e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.01 
 
 
649 aa  572  1e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  47.88 
 
 
642 aa  573  1e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.45 
 
 
656 aa  572  1e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  5.44697e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  46.56 
 
 
637 aa  574  1e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.99 
 
 
657 aa  572  1e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.85756e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.5 
 
 
645 aa  573  1e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.06 
 
 
639 aa  572  1e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.79 
 
 
608 aa  575  1e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  48.03 
 
 
639 aa  572  1e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.02 
 
 
643 aa  573  1e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.52 
 
 
650 aa  573  1e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.74852e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.36 
 
 
640 aa  571  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.19 
 
 
651 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>