11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0013 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0013  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  880    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0011  hypothetical protein  46.98 
 
 
430 aa  388  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0015  Beta-lactamase class A  33.95 
 
 
445 aa  248  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  26.82 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  28.51 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.06 
 
 
422 aa  60.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  28.63 
 
 
333 aa  56.6  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  31.25 
 
 
327 aa  53.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  25 
 
 
576 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  20.78 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  23.5 
 
 
375 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>