165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0010 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  100 
 
 
90 aa  176  6e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  91.01 
 
 
91 aa  163  6e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  73.81 
 
 
89 aa  130  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  64.2 
 
 
93 aa  114  4e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  56.82 
 
 
91 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  56.82 
 
 
91 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  56.82 
 
 
91 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  56.82 
 
 
91 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  56.82 
 
 
91 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  56.82 
 
 
91 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  56.82 
 
 
91 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  56.82 
 
 
91 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  56.82 
 
 
91 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.82 
 
 
91 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.82 
 
 
91 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  57.65 
 
 
90 aa  107  8e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  59.04 
 
 
93 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  60.71 
 
 
87 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.18 
 
 
90 aa  99  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  58.23 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.25164e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  56.25 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.58 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  2.33006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.58 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  56.96 
 
 
86 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  5.68506e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  53.09 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.32 
 
 
81 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.16 
 
 
80 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  51.9 
 
 
79 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.11292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  49.37 
 
 
80 aa  82.8  1e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.16676e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 
79 aa  81.3  4e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  45.57 
 
 
100 aa  80.9  5e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  50.63 
 
 
80 aa  77.8  5e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  49.38 
 
 
81 aa  77.4  6e-14  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  48.72 
 
 
79 aa  77  9e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.95193e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  44.94 
 
 
89 aa  76.6  1e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  41.18 
 
 
86 aa  74.3  5e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.35 
 
 
88 aa  72.8  1e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  40.91 
 
 
89 aa  72.8  1e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  1.80321e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  44.3 
 
 
90 aa  71.6  3e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  46.34 
 
 
83 aa  67  8e-11  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  43.42 
 
 
82 aa  65.1  3e-10  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  4.15805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.35 
 
 
77 aa  60.8  6e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.72 
 
 
79 aa  60.8  6e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  35.62 
 
 
87 aa  56.2  2e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  35.62 
 
 
87 aa  56.2  2e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0791  RNA-binding S4 domain protein  38.89 
 
 
133 aa  54.7  4e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.46 
 
 
135 aa  53.9  7e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  36.92 
 
 
135 aa  53.1  1e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  38.96 
 
 
141 aa  53.1  1e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.92 
 
 
135 aa  53.1  1e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.9 
 
 
135 aa  52.8  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3894  RNA-binding S4 domain protein  36.59 
 
 
136 aa  53.1  1e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  35.9 
 
 
135 aa  52.8  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  34.44 
 
 
135 aa  53.1  1e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.33 
 
 
139 aa  52.8  2e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.38 
 
 
135 aa  52  2e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  34.92 
 
 
81 aa  52.4  2e-06  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4071  RNA-binding S4 domain protein  35.37 
 
 
136 aa  52.8  2e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  37.8 
 
 
81 aa  52.4  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  36.67 
 
 
128 aa  52.4  2e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.92 
 
 
135 aa  52.8  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.38 
 
 
157 aa  52  3e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.55 
 
 
141 aa  51.2  4e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.38 
 
 
135 aa  51.2  4e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  38.1 
 
 
82 aa  51.2  5e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  45.1 
 
 
81 aa  50.8  6e-06  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  34.62 
 
 
137 aa  50.1  9e-06  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  30.77 
 
 
135 aa  50.1  1e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1304  heat shock protein 15  33.85 
 
 
135 aa  49.7  1e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  33.85 
 
 
135 aa  49.7  1e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  37.35 
 
 
134 aa  50.1  1e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.59 
 
 
138 aa  48.9  2e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 
133 aa  48.9  2e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.1 
 
 
149 aa  48.9  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1468  RNA-binding S4  41.51 
 
 
146 aa  48.9  2e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.369867  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  34.85 
 
 
81 aa  48.5  3e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  34.85 
 
 
81 aa  48.5  3e-05  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  34.85 
 
 
81 aa  48.5  3e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  38.46 
 
 
141 aa  48.1  3e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  34.07 
 
 
137 aa  47.8  4e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  44.23 
 
 
132 aa  48.1  4e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  41.18 
 
 
81 aa  47.8  5e-05  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05160  heat shock protein implicated in 50S component recycling (S4 paralogue)  32.61 
 
 
130 aa  47.8  5e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0946751  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  30.59 
 
 
135 aa  47  8e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  33.33 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3866  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  33.73 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  34.15 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  33.73 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  33.73 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3803  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  33.73 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0490537  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2926  heat shock protein 15  43.4 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00599  heat shock protein  35.38 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  40.82 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.71 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2501  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.31 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157216  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  33.73 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  42.55 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3964  putative heat shock protein 15  30.59 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3238  RNA-binding S4 domain-containing protein  35.53 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103498  normal  0.852323 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  30.77 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.679676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>