More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0001 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0001  chromosomal replication initiation protein  70 
 
 
454 aa  660  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
453 aa  927  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.817172  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0001  chromosomal replication initiation protein  47.67 
 
 
454 aa  400  1e-110  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  44.86 
 
 
440 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  42.17 
 
 
451 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  41.87 
 
 
453 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.87 
 
 
453 aa  360  3e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  42.48 
 
 
450 aa  356  6e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  42.54 
 
 
446 aa  355  9e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
446 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  42.42 
 
 
446 aa  353  4e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.42 
 
 
446 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  42.36 
 
 
450 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  42.2 
 
 
446 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  42.2 
 
 
446 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  42.2 
 
 
446 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  42.2 
 
 
446 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  42.2 
 
 
446 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 
446 aa  349  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 
446 aa  349  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.16 
 
 
449 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  47.55 
 
 
457 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.03 
 
 
453 aa  336  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  41.59 
 
 
442 aa  336  6e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  47.55 
 
 
457 aa  335  8e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  42.15 
 
 
441 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  40.53 
 
 
443 aa  328  9e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  43.46 
 
 
464 aa  323  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.3935e-05  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  40.84 
 
 
440 aa  323  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.43 
 
 
454 aa  321  1e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.53 
 
 
447 aa  321  2e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  46.22 
 
 
458 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.28 
 
 
443 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  46.22 
 
 
460 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.55 
 
 
454 aa  317  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  47.21 
 
 
450 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.4 
 
 
463 aa  313  3e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  38.41 
 
 
472 aa  312  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  45.82 
 
 
478 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  47.18 
 
 
449 aa  310  3e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  46.63 
 
 
436 aa  309  6e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  43.89 
 
 
451 aa  308  1e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.91 
 
 
446 aa  308  1e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.18 
 
 
444 aa  308  2e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  38.66 
 
 
481 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  43.65 
 
 
452 aa  306  7e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  43.65 
 
 
452 aa  306  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.74 
 
 
456 aa  305  9e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.4 
 
 
450 aa  305  1e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
524 aa  304  2e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  44.38 
 
 
511 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  45.16 
 
 
445 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  44.48 
 
 
451 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  44.48 
 
 
451 aa  301  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.38 
 
 
511 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.03 
 
 
587 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.03 
 
 
591 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  37.61 
 
 
480 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  44.09 
 
 
507 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.4 
 
 
461 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  45.45 
 
 
452 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  37.86 
 
 
453 aa  300  5e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  43.97 
 
 
478 aa  299  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
465 aa  299  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.93 
 
 
464 aa  299  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  42.94 
 
 
482 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
465 aa  298  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  44.22 
 
 
449 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  43.8 
 
 
511 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.93 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  43.8 
 
 
505 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.93 
 
 
462 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  43.77 
 
 
472 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  44.67 
 
 
494 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  43.8 
 
 
510 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  44.93 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.13 
 
 
442 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
467 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  43.8 
 
 
506 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  3.64152e-05 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.77 
 
 
480 aa  297  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  44.93 
 
 
467 aa  297  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  43.77 
 
 
462 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.74 
 
 
455 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 
466 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  44.48 
 
 
459 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  43.77 
 
 
462 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  43.77 
 
 
462 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 
466 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 
466 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 
466 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  43.77 
 
 
462 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 
466 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.64 
 
 
483 aa  296  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  43.77 
 
 
461 aa  296  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  43.77 
 
 
462 aa  296  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.11976e-10  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>