More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3205 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3205  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 111 aa  215  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0204  TPR repeat-containing protein  42.45 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0438861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0023  TPR repeat-containing protein  43.69 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.727906  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0051  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0064  TPR domain-containing protein  37.25 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0080  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0013  hypothetical protein  36 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46510  hypothetical protein  37.74 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0247352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0083  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  hitchhiker  0.0000000163177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0080  tetratricopeptide domain-containing protein  36.36 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.163561  hitchhiker  0.00000000000757426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0015  TPR domain-containing protein  34.34 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1820  Tetratricopeptide TPR_4  35.87 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.452931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1514  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0354  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3481  hypothetical protein  36.79 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3565  hypothetical protein  36.79 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.65733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3633  hypothetical protein  36.79 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00160  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2284  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0435427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3592  TPR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  43.06 
 
 		 585 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2265  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.635279  normal  0.073962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2536  tetratricopeptide TPR_2  40.22 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.949555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2621  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 616 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  37.65 
 
 		 635 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2058  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0442848 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 865 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4712  hypothetical protein  39.62 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 448 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 574 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 599 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 402 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  30 
 
 		 282 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0926  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 870 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.58 
 
 		 248 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 1450 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  41.18 
 
 		 637 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  31.17 
 
 		 642 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 584 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  37.31 
 
 		 887 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  38.96 
 
 		 584 aa  50.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 550 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 		 645 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 595 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  31.17 
 
 		 645 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.25 
 
 		 810 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  36.84 
 
 		 620 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 547 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5430  hypothetical protein  29.35 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0651614 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 827 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  29.87 
 
 		 436 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  30.53 
 
 		 587 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 864 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 374 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  38.27 
 
 		 587 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.55 
 
 		 340 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 575 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 595 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  34.67 
 
 		 725 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 505 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 311 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.88 
 
 		 232 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 589 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 594 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  35.06 
 
 		 545 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 1714 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 291 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  40.3 
 
 		 520 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 556 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 718 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 265 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 681 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 566 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 878 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  43.28 
 
 		 573 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 688 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 3560 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  37.33 
 
 		 266 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 637 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.13 
 
 		 409 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1242  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  42.42 
 
 		 572 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  32.26 
 
 		 625 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 		 557 aa  47  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  33.8 
 
 		 661 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  32.35 
 
 		 725 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 556 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  31.76 
 
 		 603 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  32.88 
 
 		 590 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  36 
 
 		 609 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 620 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  37.5 
 
 		 467 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 3301 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  32.32 
 
 		 807 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 464 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>