More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3190 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3661  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0301  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  30.63 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 280 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  42.19 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 424 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 414 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  36.11 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  34.74 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  46.43 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>