More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3183 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 126 aa  248  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  60.32 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  60.8 
 
 		 126 aa  158  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  56.59 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  61.06 
 
 		 128 aa  147  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  55.38 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  55.38 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  53.85 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  60.48 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  52.89 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  56.91 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 127 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  55.28 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  52.31 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 128 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  55.12 
 
 		 128 aa  143  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  55.17 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  57.72 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  62.96 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  57.52 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  56.03 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  55.04 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  55.93 
 
 		 129 aa  141  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  59.63 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  53.49 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 130 aa  140  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  60.55 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  139  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  53.66 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  55.38 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  52 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  59.62 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  56.45 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  56.25 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  52.71 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  52.71 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  54.26 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  55.08 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  53.08 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  54.26 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  53.66 
 
 		 125 aa  137  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  55.46 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  52.24 
 
 		 134 aa  137  7e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 140 aa  136  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  57.55 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  51.38 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  56.1 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  54.76 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  55.75 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  55.66 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  56.91 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  55.81 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  55.81 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  50.81 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  55.81 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  56.64 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  57.52 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  54.26 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 127 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>