More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3158 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  100 
 
 		 507 aa  996    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0238  Na+/solute symporter  46.14 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.758968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  39.23 
 
 		 495 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2298  Na+/solute symporter  36.04 
 
 		 503 aa  291  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2953  Na+/solute symporter  35.46 
 
 		 486 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3138  Na+/solute symporter  34.76 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0742  sodium/solute symporter family protein  34.4 
 
 		 490 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5313  Na+/solute symporter  34.16 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0596  Na+ symporter  32.12 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4595  sodium/solute symporter family protein  34.4 
 
 		 490 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.18297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3338  Na+/solute symporter  35.81 
 
 		 490 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3173  Na+/solute symporter  35.33 
 
 		 490 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1295  SSS family Na(+)/monocarboxylate symporter  33.74 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0157462  normal  0.364511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0777  sodium/solute symporter family protein  33.97 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0674  sodium/solute symporter family protein  33.97 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.654246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0618  sodium/solute symporter family protein  33.97 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0618  sodium/solute symporter family protein  33.97 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.299893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0708  sodium/solute symporter family protein  33.97 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0623  Na+/solute symporter  33.55 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0762  sodium/solute symporter family protein  33.97 
 
 		 490 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0836  sodium/solute symporter family protein  33.76 
 
 		 490 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4890  Na+/solute symporter  33.33 
 
 		 486 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0767  Na+ symporter  33.05 
 
 		 492 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4426  Na+/solute symporter  34.04 
 
 		 486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2389  Na+/solute symporter  30.63 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2476  Na+/solute symporter  31.05 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4936  Na+/solute symporter  32.91 
 
 		 486 aa  221  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0902202  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2870  Na+/solute symporter  33.96 
 
 		 486 aa  210  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2434  Na+/solute symporter  30.5 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1420  Na+/solute symporter  26.82 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2757  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.82 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000172913  normal  0.0830258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1309  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.82 
 
 		 486 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0201  Na+/solute symporter  30.5 
 
 		 492 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0231312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1541  Na+/solute symporter  30.73 
 
 		 524 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2736  Na+/solute symporter  29.03 
 
 		 498 aa  160  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00980932  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3191  Na+/solute symporter  27.18 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2133  Na+/solute symporter  30.83 
 
 		 494 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.829597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  28.01 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0555  Na+ symporter  27.5 
 
 		 488 aa  153  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0425968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  30.51 
 
 		 479 aa  153  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1232  Na+/solute symporter  31 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  26.8 
 
 		 474 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3259  Na+/solute symporter  30.31 
 
 		 494 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  27.13 
 
 		 497 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.2 
 
 		 518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.27 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.18 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.54 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.54 
 
 		 492 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.54 
 
 		 492 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  27.43 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  26.49 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  30.61 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.34 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  26.73 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.34 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.34 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  26.53 
 
 		 524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  26.29 
 
 		 494 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  28.76 
 
 		 506 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  26.44 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.36 
 
 		 504 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  28.54 
 
 		 506 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  28.2 
 
 		 484 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.34 
 
 		 492 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4608  Na+/solute symporter  26.65 
 
 		 547 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26 
 
 		 482 aa  124  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  28.11 
 
 		 484 aa  124  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27.01 
 
 		 492 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  28.38 
 
 		 492 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  25.7 
 
 		 540 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  27.15 
 
 		 502 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.95 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0062  Na+/solute symporter  24.73 
 
 		 503 aa  120  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1164  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.58 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4360  Na+/solute symporter  24.28 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  25.9 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  26.33 
 
 		 492 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  27.31 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5756  Na+/solute symporter  25.23 
 
 		 460 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0960  sodium:solute symporter family protein  25 
 
 		 516 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316109  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  24.65 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  26.95 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2363  Na+/solute symporter  25.91 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.433479  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3934  Na+/solute symporter  28.38 
 
 		 502 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3821  Na+/solute symporter  28.38 
 
 		 502 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.154963  normal  0.247868 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.17 
 
 		 500 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  26.76 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  26.04 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1725  Na+/solute symporter  24.46 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0503344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2337  Na+/solute symporter  24.46 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2360  Na+/solute symporter  24.24 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1942  sodium:solute symporter family protein  24.73 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1323  sodium:solute symporter family protein  24.73 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.714552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1172  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.73 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0294  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.73 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.459354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1011  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.73 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519427  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0854  sodium:solute symporter family protein  24.73 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>