More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3134 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  627  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  56.52 
 
 		 324 aa  351  8.999999999999999e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  53.06 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  54.76 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  54.42 
 
 		 314 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3313  hypothetical protein  53.4 
 
 		 314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3600  hypothetical protein  51.7 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0605544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0308  hypothetical protein  52.38 
 
 		 313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  51.7 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  51.36 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3917  hypothetical protein  52.04 
 
 		 316 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0248233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  50.17 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8066  hypothetical protein  49.15 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6110  hypothetical protein  49.66 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.749833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0066  hypothetical protein  51.54 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.909485 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6185  hypothetical protein  49.32 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3429  hypothetical protein  47.78 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4163  hypothetical protein  45.63 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000721269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3549  hypothetical protein  47.1 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1234  hypothetical protein  49.47 
 
 		 319 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3010  hypothetical protein  47.39 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0395  hypothetical protein  47.84 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.172909  normal  0.115036 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2072  hypothetical protein  50.36 
 
 		 319 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1642  hypothetical protein  50.36 
 
 		 319 aa  265  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.274465  normal  0.0446405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3704  hypothetical protein  47.1 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2009  hypothetical protein  49.46 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2148  hypothetical protein  47.54 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.479572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3004  hypothetical protein  45.21 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.033569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1829  hypothetical protein  46.58 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  0.517051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2569  hypothetical protein  47.39 
 
 		 319 aa  258  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0034025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0361  hypothetical protein  45.21 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.662417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3502  hypothetical protein  44.18 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.819446  normal  0.192099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2518  hypothetical protein  46.76 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5905  hypothetical protein  41.5 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.339531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3011  hypothetical protein  48.92 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2509  hypothetical protein  42.23 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0752263  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1395  hypothetical protein  42.23 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0574924  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3075  hypothetical protein  43.8 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37830  hypothetical protein  43.43 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0596  hypothetical protein  42.23 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3625  hypothetical protein  44.11 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3102  hypothetical protein  41.41 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.571018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3248  hypothetical protein  42.47 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273356  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3299  hypothetical protein  42.12 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0536538  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3237  hypothetical protein  42.12 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1042  hypothetical protein  40.07 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2012  twin-arginine translocation pathway signal  39.13 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0323  hypothetical protein  39.35 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5058  hypothetical protein  38.21 
 
 		 358 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.354156 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  35.97 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0998  hypothetical protein  36.05 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1237  hypothetical protein  36.64 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.462545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00840  hypothetical protein  36.73 
 
 		 335 aa  188  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0173913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4958  hypothetical protein  35.87 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  34.29 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  32.54 
 
 		 323 aa  168  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2192  hypothetical protein  33.22 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  32.69 
 
 		 336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02414  hypothetical protein  30.51 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6270  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.64 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0141318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0861  hypothetical protein  32.65 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2741  hypothetical protein  34.4 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0278237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1873  hypothetical protein  31.42 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797689  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  33 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  34.44 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0872  hypothetical protein  32.31 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0855  hypothetical protein  32.31 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.769055  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003384  putative tricarboxylic transport TctC  30.51 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2897  hypothetical protein  32.45 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3342  hypothetical protein  34.04 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.019229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  30.9 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3489  hypothetical protein  32.3 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2117  hypothetical protein  32.92 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.820451  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0839  hypothetical protein  28.83 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00353012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0813  hypothetical protein  28.62 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1011  putative lipoprotein  27.84 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.9236  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  30.64 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4344  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0136809  hitchhiker  0.000000000438941 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1006  tricarboxylate-binding protein  28.98 
 
 		 322 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0967  tricarboxylate-binding protein  27.78 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0871  putative lipoprotein  27.86 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  30.46 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  29.19 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0925  putative lipoprotein  27.86 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1457  hypothetical protein  31.76 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1825  hypothetical protein  31.85 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1418  tricarboxylate transport protein TctC, putative  30.46 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4303  hypothetical protein  30.46 
 
 		 326 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2965  tricarboxylic transport  32.63 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1091  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  28.33 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3085  tricarboxylic transport  32.63 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2982  tricarboxylic transport  32.63 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.672552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2898  tricarboxylic transport  32.63 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2930  tricarboxylic transport  32.63 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  30.48 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  28.67 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2581  hypothetical protein  30.6 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  29.87 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0925  hypothetical protein  29.39 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.524752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>