More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3132 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 227 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  37.7 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 247 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.98 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1630  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1608  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0385519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1758  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0256376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1808  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  38.57 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 214 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 219 aa  99  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  34.33 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>