228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3124 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3124  homoserine kinase  100 
 
 
310 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  43.3 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  43.43 
 
 
297 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  49.3 
 
 
296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  44.79 
 
 
301 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  39.39 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  40.47 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  39.53 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  40.54 
 
 
305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1074  homoserine kinase  51.51 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  41.45 
 
 
306 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  42.63 
 
 
316 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  40.94 
 
 
304 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  37.25 
 
 
311 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  42.67 
 
 
315 aa  209  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  42.67 
 
 
315 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  40.2 
 
 
303 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  42.71 
 
 
304 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  41.25 
 
 
315 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  36.52 
 
 
304 aa  200  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  41.25 
 
 
315 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  42.76 
 
 
317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  40 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  36.43 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  38.08 
 
 
315 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  38.67 
 
 
315 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  39.14 
 
 
315 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  36.75 
 
 
305 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  42.48 
 
 
314 aa  192  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  36.75 
 
 
305 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  37.16 
 
 
302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14830  homoserine kinase  44.94 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17524  normal  0.116843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  38.61 
 
 
300 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1057  homoserine kinase  44.81 
 
 
317 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175086  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0118  homoserine kinase  42.19 
 
 
303 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0883  homoserine kinase  41.97 
 
 
307 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000117754  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1788  homoserine kinase  39.54 
 
 
317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.542876  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0885  homoserine kinase  41.42 
 
 
310 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  41.58 
 
 
303 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1201  homoserine kinase  42.07 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2463  homoserine kinase  46.51 
 
 
310 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0910  homoserine kinase  36.84 
 
 
311 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1283  homoserine kinase  46.79 
 
 
311 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19320  homoserine kinase  43.68 
 
 
304 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0246  homoserine kinase  33.33 
 
 
294 aa  167  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00137655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3355  homoserine kinase  35.14 
 
 
297 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000409306  hitchhiker  0.0000000000000103928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1498  homoserine kinase  35.47 
 
 
297 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  31.14 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1835  homoserine kinase  35.14 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.439683  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0220  homoserine kinase  31.19 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000123965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1972  homoserine kinase  35.14 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0856158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1827  homoserine kinase  33.77 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.115577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1801  homoserine kinase  34.46 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0151771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1784  homoserine kinase  33.44 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1970  homoserine kinase  33.77 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.358252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2004  homoserine kinase  34.46 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.268179999999999e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2053  homoserine kinase  33.78 
 
 
297 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2075  homoserine kinase  34.12 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000541431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  33.56 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2894  homoserine kinase  36.54 
 
 
304 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.710654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1300  homoserine kinase  41.89 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0147  homoserine kinase  32.88 
 
 
292 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00399009  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0674  homoserine kinase  31.71 
 
 
293 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0444063  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46461  predicted protein  36.59 
 
 
426 aa  156  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.5833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2422  homoserine kinase  38.39 
 
 
316 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  40.51 
 
 
284 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0950  homoserine kinase  41.03 
 
 
290 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3039  homoserine kinase  37.5 
 
 
304 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10263  predicted protein  39.08 
 
 
265 aa  155  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111228  normal  0.879833 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0129  homoserine kinase  32.54 
 
 
292 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0169  homoserine kinase  32.54 
 
 
292 aa  155  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00243862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4151  homoserine kinase  40.33 
 
 
321 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  31.16 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3936  homoserine kinase  40.32 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0320  homoserine kinase  37.5 
 
 
320 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.234549 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  32.44 
 
 
296 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1007  homoserine kinase  42.05 
 
 
317 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1493  homoserine kinase  30.24 
 
 
294 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00125886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1479  homoserine kinase  36.66 
 
 
315 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09890  homoserine kinase  38.85 
 
 
315 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0507  homoserine kinase  34.01 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2050  homoserine kinase  40.15 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.189135  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0632  homoserine kinase  43.42 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.305614  decreased coverage  0.0010744 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1368  homoserine kinase  27.7 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4029  homoserine kinase  42.19 
 
 
314 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0785  homoserine kinase  36.19 
 
 
292 aa  146  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1495  homoserine kinase  31.16 
 
 
293 aa  146  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.122475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1650  Homoserine kinase  36.72 
 
 
336 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1074  homoserine kinase  33.33 
 
 
287 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000054772  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85224  homoserine kinase  30.66 
 
 
353 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.481244  normal  0.37391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2720  homoserine kinase  34.55 
 
 
304 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.46169  normal  0.699908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3647  homoserine kinase  41.81 
 
 
309 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.529848  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  29.43 
 
 
304 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  29.43 
 
 
304 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1023  homoserine kinase  41.41 
 
 
323 aa  143  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1230  homoserine kinase  33.73 
 
 
355 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0392  homoserine kinase  34.9 
 
 
281 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2354  homoserine kinase  36.48 
 
 
324 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000501713 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0375  homoserine kinase  34.9 
 
 
281 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0538  homoserine kinase  33.33 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.283285  unclonable  0.0000000181031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>