More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3118 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
334 aa  657    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  45.87 
 
 
312 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  36.28 
 
 
320 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  43.09 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  45.97 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  44.37 
 
 
328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  37.69 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 
315 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0059  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 
335 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  42.34 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  34.52 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
345 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
313 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
336 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  35.71 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
359 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
343 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  33.02 
 
 
358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  43.43 
 
 
262 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  32.59 
 
 
339 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
337 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
353 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  32.27 
 
 
339 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
337 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
346 aa  155  8e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
330 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
339 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
332 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  33.07 
 
 
338 aa  149  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
331 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  30.42 
 
 
330 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
314 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
355 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
822 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
841 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
341 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
841 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
350 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
300 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
337 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
836 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
358 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  40.09 
 
 
279 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
307 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 
346 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 
286 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
302 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 
401 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
300 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 
325 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  35.43 
 
 
283 aa  123  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
294 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
616 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 
1340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 
311 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.82 
 
 
838 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
290 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.18 
 
 
322 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 
324 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  29.88 
 
 
336 aa  117  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  29.66 
 
 
652 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
303 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
1523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  38.57 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
311 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1383  glycosyltransferase-like protein  33.93 
 
 
954 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
1523 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 
1739 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.2 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
1267 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
280 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
1267 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
1077 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
335 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
307 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
311 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
346 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
288 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
342 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 
282 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>