More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3117 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  100 
 
 		 436 aa  873    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  41.12 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  43.78 
 
 		 870 aa  289  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  37.93 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  36.31 
 
 		 493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  39.31 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  39.23 
 
 		 421 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  38.3 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  41.16 
 
 		 429 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.13 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  38.92 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  37.83 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  36.67 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  35.15 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  36.95 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  53.25 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  35.29 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  38.18 
 
 		 416 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  39.94 
 
 		 488 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  36.73 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  34.3 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  34.99 
 
 		 405 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  36.69 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  38.34 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  35.94 
 
 		 424 aa  256  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  41.67 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  33.56 
 
 		 415 aa  251  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  51.71 
 
 		 816 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 469 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 465 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 465 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.27 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.27 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.27 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 		 471 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  40.67 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  49.36 
 
 		 711 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  35.14 
 
 		 410 aa  246  8e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.99 
 
 		 424 aa  246  8e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  35.81 
 
 		 498 aa  246  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  34.62 
 
 		 457 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  47.92 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  48.64 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  48.32 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  35.73 
 
 		 472 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  33.94 
 
 		 440 aa  239  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  36.2 
 
 		 418 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  37.18 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  48.35 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  40.06 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  37.38 
 
 		 448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  39.44 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  40.06 
 
 		 428 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  41.5 
 
 		 422 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  45.27 
 
 		 254 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  35.15 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  36.41 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  34.88 
 
 		 437 aa  229  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  34 
 
 		 464 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  31.7 
 
 		 425 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  35.82 
 
 		 429 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  41.63 
 
 		 549 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  47.52 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  35.68 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2170  putative ABC transporter  35.64 
 
 		 431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  51.74 
 
 		 369 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  44.86 
 
 		 247 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  35.75 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  34.99 
 
 		 412 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  30.98 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  44.14 
 
 		 549 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  50.46 
 
 		 422 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  38.8 
 
 		 427 aa  219  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.27 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  40.97 
 
 		 435 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  44.14 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  44.14 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  52.45 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  37.46 
 
 		 422 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  37.13 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  50.5 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  39.68 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  47.64 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  45.68 
 
 		 254 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  49.07 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  45.68 
 
 		 254 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 395 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  47.75 
 
 		 428 aa  216  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  45.27 
 
 		 254 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  48.31 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  33.95 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  47.8 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  44.54 
 
 		 416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>