More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3107 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
452 aa  900  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 
445 aa  236  5e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
441 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
447 aa  219  9e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
452 aa  214  2e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
436 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
466 aa  197  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
733 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
462 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
782 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  25.68 
 
 
778 aa  137  3e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
418 aa  133  7e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
413 aa  128  2e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
539 aa  128  2e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  28.25 
 
 
425 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
425 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  28.29 
 
 
413 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
440 aa  118  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0478  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 
442 aa  116  9e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.038549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
428 aa  111  2e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
419 aa  110  4e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
401 aa  110  7e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
440 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
426 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
414 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.84 
 
 
412 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
409 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
924 aa  100  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
358 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.6 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  38.07 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
403 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  28.01 
 
 
403 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
401 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
394 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
414 aa  97.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
398 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
415 aa  93.6  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
435 aa  92  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.72843e-05 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
403 aa  90.9  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
410 aa  89.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13821  hypothetical protein  23.01 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.27 
 
 
401 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  38.43 
 
 
739 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
395 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
414 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0256  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.21 
 
 
355 aa  85.1  2e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
392 aa  85.9  2e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  26.88 
 
 
384 aa  85.5  2e-15  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
420 aa  85.5  2e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
397 aa  84.3  4e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
404 aa  84.3  4e-15  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
391 aa  84.3  4e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
410 aa  83.6  6e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
390 aa  83.2  8e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 
353 aa  82.8  1e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  36.51 
 
 
388 aa  82.8  1e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
404 aa  81.6  3e-14  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
396 aa  80.9  5e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
423 aa  80.5  6e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
750 aa  80.5  6e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
393 aa  80.1  8e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  40 
 
 
775 aa  79.7  9e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
381 aa  79.7  9e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
372 aa  79.7  9e-14  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
417 aa  79.3  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 
403 aa  79.7  1e-13  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  22.13 
 
 
392 aa  79.3  1e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
392 aa  79  1e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
406 aa  79.7  1e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
362 aa  78.6  2e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
445 aa  79  2e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
419 aa  78.6  2e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
392 aa  78.2  3e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
405 aa  78.2  3e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  34.13 
 
 
389 aa  77.8  4e-13  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  29.64 
 
 
564 aa  77.4  4e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
367 aa  77.8  4e-13  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
419 aa  77.8  4e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
411 aa  77  6e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
374 aa  76.6  9e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
417 aa  76.3  1e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
445 aa  76.3  1e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
360 aa  76.3  1e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
406 aa  75.1  2e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
363 aa  75.1  2e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  31.75 
 
 
408 aa  75.5  2e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
772 aa  75.5  2e-12  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
406 aa  74.3  4e-12  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
393 aa  74.3  4e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
405 aa  73.9  5e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 
343 aa  73.9  5e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>