249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3043 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  100 
 
 		 266 aa  533  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  36.73 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  39.62 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  39.62 
 
 		 278 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 		 250 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 		 250 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  31.98 
 
 		 250 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 		 250 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  32.97 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  28.98 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  30.43 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  38.65 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  28.29 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  30.1 
 
 		 253 aa  72  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  32.76 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  23.3 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  26.34 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  33.53 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  31.25 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  32.24 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  31.35 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  26.29 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  34.25 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  30.64 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0540  beta-lactamase-like protein  33.57 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  27.98 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  30.71 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  29.24 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  31.84 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  36.84 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  27.55 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  29.67 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  27.04 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  29.67 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  37.69 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  27.06 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  25.31 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  30.07 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  29.24 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  31.82 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  27.27 
 
 		 330 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  33.68 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  35.51 
 
 		 312 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  31.54 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  22.05 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  31.11 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  35.71 
 
 		 94 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  33.62 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5078  beta-lactamase domain-containing protein  28.15 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  27.83 
 
 		 329 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  26.67 
 
 		 344 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41810  Zn-dependent hydrolase  26.32 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 		 324 aa  52  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.76 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1412  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270255  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  31.93 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  21.82 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  26.15 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  31.98 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  30.89 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>