166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3015 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  58.54 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  50.62 
 
 		 243 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  52.08 
 
 		 241 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  54.77 
 
 		 243 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  55.28 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  54.88 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  52.19 
 
 		 254 aa  242  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  52.48 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  50.61 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  46.94 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  46.94 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  56.47 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  51.43 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  51.44 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.58 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  49.8 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  46.15 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  44.98 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  49.79 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.17 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.17 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.26 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  45.35 
 
 		 270 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.53 
 
 		 262 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  47.01 
 
 		 744 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  43.15 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  43.15 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.87 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  42.28 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  43.15 
 
 		 243 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  41.49 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.62 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  41.67 
 
 		 235 aa  168  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  41.98 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  40.25 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  42 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  35.68 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  41.63 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.99 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  39.59 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  43.13 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  37.95 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.06 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  39.06 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.16 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  43.04 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.18 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  38.63 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.9 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  42.37 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  41.95 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  40.64 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  38.2 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  39.27 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.82 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  35.32 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  39.47 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  40.59 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.7 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  36.48 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.6 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  35.62 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.04 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  37.7 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  32.89 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  31.58 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  30.73 
 
 		 501 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  33.5 
 
 		 494 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  28.91 
 
 		 485 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  26.54 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  30.46 
 
 		 506 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  29.82 
 
 		 502 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  30.11 
 
 		 494 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  28.8 
 
 		 776 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  34.68 
 
 		 492 aa  52.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  30.17 
 
 		 485 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  28.57 
 
 		 772 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  30.08 
 
 		 512 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  33.6 
 
 		 477 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  29.91 
 
 		 484 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  28.49 
 
 		 493 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  34.65 
 
 		 483 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  29.03 
 
 		 489 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.71 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  32.2 
 
 		 534 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  32.56 
 
 		 490 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  29.31 
 
 		 475 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  33.33 
 
 		 536 aa  49.3  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  33.91 
 
 		 498 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  27.54 
 
 		 465 aa  48.5  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.61 
 
 		 455 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  32.09 
 
 		 490 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  32.58 
 
 		 514 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  31.36 
 
 		 488 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  31.41 
 
 		 512 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  31.41 
 
 		 531 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  31.41 
 
 		 523 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  31.41 
 
 		 545 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  31.41 
 
 		 535 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>