More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3002 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  100 
 
 		 336 aa  639    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  49.65 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  45.51 
 
 		 345 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  45.02 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  49.37 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  51.77 
 
 		 327 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  46.9 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  47.89 
 
 		 309 aa  242  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  43.24 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  42.59 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  42.95 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  45.42 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  48.23 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7475  monosaccharide-transporting ATPase  46.75 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  49.16 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  49.68 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  47.59 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.37 
 
 		 345 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  41.07 
 
 		 341 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  46.5 
 
 		 835 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  45.45 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  45.86 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  44.48 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  43.37 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  47.79 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  43.73 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 345 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  47.79 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  47.79 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  43.37 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  42.77 
 
 		 345 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  44.51 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  42.34 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  43.77 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  49.09 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  41.34 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  41.34 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  45.63 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  41.34 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  48.78 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  42.31 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 314 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  45.12 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  47.72 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  44.01 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  44.12 
 
 		 334 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  41.9 
 
 		 347 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  46.86 
 
 		 310 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  44.77 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  47.74 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.36 
 
 		 323 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  43.99 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  47.37 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  43.22 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  42.71 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  42.49 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0342  inner-membrane translocator  42.51 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  42.22 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  42.22 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  42.22 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  47.45 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  47.18 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.07 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.07 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  41.84 
 
 		 341 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  43.14 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  42.07 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  42.34 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  42.07 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  42.72 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  43.86 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  42.07 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  44.11 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  40.32 
 
 		 346 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.07 
 
 		 341 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  41.64 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  43.25 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  43.25 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  41.53 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  43 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  43.25 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  43.96 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  45.23 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  41.87 
 
 		 314 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  43.97 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>