More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2996 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 206 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  35.48 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  38.82 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8868  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 374 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
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NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_3716  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
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NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
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