More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2954 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  100 
 
 		 217 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  39.81 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  39.13 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  34.7 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  37.93 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  36.36 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  35.44 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  35.44 
 
 		 212 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  37.44 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.51 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  34.43 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  36.59 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.69 
 
 		 232 aa  99  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.47 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  36.6 
 
 		 220 aa  94.7  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5613  peptidase S16 lon domain protein  29.33 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.58 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  36.14 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  34 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  32.69 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  30.77 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  32.98 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  35.23 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  32 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  32.47 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  33.16 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  34.65 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.6 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  30.62 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  32.66 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  30.95 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  28.85 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  25.12 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  31.16 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  37.11 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  30.29 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  32.66 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  31.13 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  28.85 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.56 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  32.16 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.16 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.16 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.8 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  31.63 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  31.63 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  31.63 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  31.63 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  31.12 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  31.63 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  31.63 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  31.63 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  32.29 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.96 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.96 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.46 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  32.64 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  33.16 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.11 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.17 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 		 824 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  38.74 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  25.24 
 
 		 846 aa  69.3  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  32.99 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  29.33 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.84 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.94 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.68 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  31.53 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.73 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  31.75 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.76 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  37.84 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.04 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.16 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  28.06 
 
 		 828 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  28.37 
 
 		 785 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.69 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  34.13 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  34.09 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.96 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  28.28 
 
 		 843 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  31.98 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  30.65 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  30.65 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  28.28 
 
 		 835 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  28.28 
 
 		 835 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  37.93 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.78 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.78 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  30.27 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  38.04 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.78 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  34.54 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.93 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.93 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  27.23 
 
 		 800 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  26.07 
 
 		 818 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>