66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2937 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 
195 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  55.49 
 
 
216 aa  194  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  55.7 
 
 
215 aa  177  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  50.27 
 
 
218 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  62.86 
 
 
267 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  48.28 
 
 
217 aa  158  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  51.05 
 
 
263 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  50.85 
 
 
270 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  46.1 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  39.42 
 
 
268 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  37.25 
 
 
262 aa  58.9  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  36.84 
 
 
381 aa  56.6  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  34.62 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  35.11 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  33.56 
 
 
192 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  33.33 
 
 
377 aa  55.1  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  31.65 
 
 
327 aa  54.7  0.0000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  34.51 
 
 
249 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  32.58 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  32.98 
 
 
250 aa  52.8  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  33.33 
 
 
365 aa  52  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  33.6 
 
 
291 aa  51.6  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  36 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  35.48 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  35 
 
 
339 aa  50.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  33.04 
 
 
377 aa  49.7  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  34.17 
 
 
238 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  31.15 
 
 
384 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.14 
 
 
270 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  27.74 
 
 
265 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  38.46 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  38.46 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  34.78 
 
 
253 aa  48.9  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.46 
 
 
233 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  30.97 
 
 
293 aa  48.9  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  33.07 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  32.17 
 
 
279 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  33.33 
 
 
337 aa  47.8  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  27.01 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  41.1 
 
 
298 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  28.57 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  29.2 
 
 
242 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.77 
 
 
222 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  34.48 
 
 
307 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  34.44 
 
 
350 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.7 
 
 
336 aa  45.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  34.21 
 
 
324 aa  45.1  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  28.48 
 
 
316 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  38.2 
 
 
354 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  31.86 
 
 
260 aa  44.7  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.72 
 
 
243 aa  44.7  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  34.45 
 
 
323 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  32.28 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  35.42 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  35.87 
 
 
235 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  30.17 
 
 
294 aa  42.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  30.7 
 
 
316 aa  42.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  29.3 
 
 
270 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  28.15 
 
 
292 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  27.74 
 
 
268 aa  41.6  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>