241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2923 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  100 
 
 		 306 aa  604  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  42.96 
 
 		 306 aa  244  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  40.78 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  42.37 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  39.66 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  41.22 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  36.56 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  36.56 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  36.56 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  36.56 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  36.56 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  36.56 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  36.56 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  36.56 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  36.56 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  36.2 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  37.09 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  35.84 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  41.13 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  41.97 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  35.13 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  43.15 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  41.45 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  41.28 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  37.41 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  39.8 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  36.33 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  36.33 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  36.33 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  41.07 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  39.26 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  40.49 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  39.73 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  34.98 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  38.3 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  34.42 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  38.54 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  37.32 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  36.21 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  38.87 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  36.15 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  35.23 
 
 		 310 aa  158  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  34.53 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  36.61 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  34.14 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  35.79 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  36.93 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  35.41 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  35.48 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  32.83 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  32.83 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  35.42 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  34.67 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  29.41 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  35.1 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  33.57 
 
 		 279 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  34.74 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  35.64 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  38.25 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  26.74 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  33.22 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  30.56 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  31.87 
 
 		 321 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.96 
 
 		 993 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.31 
 
 		 1001 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  26.38 
 
 		 271 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.91 
 
 		 991 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.91 
 
 		 991 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.74 
 
 		 991 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.61 
 
 		 993 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.83 
 
 		 990 aa  92.8  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.78 
 
 		 1004 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.65 
 
 		 1003 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.62 
 
 		 1004 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.41 
 
 		 1006 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.27 
 
 		 1013 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.03 
 
 		 1004 aa  89.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  25.68 
 
 		 996 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  30.18 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.81 
 
 		 1003 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.75 
 
 		 1002 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.23 
 
 		 1001 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  28.41 
 
 		 1028 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3164  Proline dehydrogenase  30.19 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  28.04 
 
 		 975 aa  72.4  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13950  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.79 
 
 		 1054 aa  70.1  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.670701  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07096  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.78 
 
 		 1043 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.49 
 
 		 1221 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0656  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.15 
 
 		 1236 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54170  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.54 
 
 		 1060 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4737  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.54 
 
 		 1060 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001017  proline dehydrogenase (Proline oxidase)/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.7 
 
 		 1043 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2428  proline dehydrogenase  28.52 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.342567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0663  proline dehydrogenase  25.26 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.364988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4428  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.93 
 
 		 1040 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1325  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.77 
 
 		 1204 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2326  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.24 
 
 		 1147 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0570  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.97 
 
 		 1241 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0555  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.36 
 
 		 1055 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.637208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6455  Proline dehydrogenase  22.63 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>