More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2916 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2916  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
239 aa  470  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  34.08 
 
 
240 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1078  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 
402 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1873  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
244 aa  82  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.871278  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1399  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.290066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2902  metallo-beta-lactamase family protein  28.28 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.150382  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2428  metallo-beta-lactamase family protein  27.32 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0769  beta-lactamase domain-containing protein  34.91 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.310253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2561  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000265837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  27.06 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2221  Zn-dependent hydrolase  27.4 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448191  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  23.96 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  32.47 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3996  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590455  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  26.98 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2424  beta-lactamase domain protein  31.56 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.238173  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1391  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.354164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2879  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191235  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  26.19 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  26.77 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2292  beta-lactamase domain protein  30.47 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0204091  normal  0.304902 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5818  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 
294 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  30.83 
 
 
361 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  26.51 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  26 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  26.51 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  26.51 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  26.51 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  26.51 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  26.19 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5606  beta-lactamase domain protein  33.03 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  26.98 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2266  Zn-dependent hydrolase  25.49 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.064814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2569  metallo-beta-lactamase family protein  27.03 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0247403  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5582  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2167  beta-lactamase domain protein  23.74 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330732  normal  0.0181786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3562  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000949082  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  33.53 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1047  beta-lactamase domain-containing protein  30.47 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  31.61 
 
 
317 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2298  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2384  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  32.18 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  32.18 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2472  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.760184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2493  metallo-beta-lactamase family protein  24.51 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2127  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0013409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  28.65 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  31.61 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0508  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  31.61 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0424  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.65466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  29.71 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  26.44 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2427  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501309  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  31.61 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4832  beta-lactamase domain-containing protein  29.01 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2191  beta-lactamase domain protein  35.96 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  29.71 
 
 
285 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
321 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  29.61 
 
 
281 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4522  beta-lactamase domain protein  31.8 
 
 
299 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231723  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  27.45 
 
 
285 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
310 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2493  beta-lactamase-like  28.5 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4636  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
299 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3529  beta-lactamase-like  30.17 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5141  metallo-beta-lactamase family protein  28.4 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4716  metallo-beta-lactamase family protein  26.34 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  27.45 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  32.57 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4154  beta-lactamase domain-containing protein  31.8 
 
 
299 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1675  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  27.37 
 
 
285 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 
281 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
317 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5146  metallo-beta-lactamase family protein  25.45 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  27.04 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.06 
 
 
256 aa  62  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4874  metallo-beta-lactamase family protein  25.99 
 
 
240 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5245  metallo-beta-lactamase family protein  25.99 
 
 
240 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  29.52 
 
 
330 aa  62  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1101  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5152  metallo-beta-lactamase family protein  28.83 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.810942  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  32.37 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1760  Zn-dependent hydrolase including glyoxylases  30.1 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4731  metallo-beta-lactamase family protein  27.88 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 
311 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4192  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
297 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>