75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2899 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 
215 aa  438  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  53.37 
 
 
218 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  47.87 
 
 
217 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  60.93 
 
 
216 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  55.7 
 
 
195 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  55 
 
 
267 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  48.61 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  41.26 
 
 
270 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  39.55 
 
 
207 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  40.2 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  40.2 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.56 
 
 
243 aa  62  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  36.56 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  34.41 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  38.38 
 
 
412 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  36.63 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  36.63 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  30.3 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  32.59 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  34.95 
 
 
249 aa  51.6  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  29.55 
 
 
242 aa  52  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  32.12 
 
 
327 aa  51.2  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  33.66 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  32.56 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  37.88 
 
 
365 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  33.88 
 
 
381 aa  50.1  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  31.88 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  37.04 
 
 
339 aa  48.9  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  36.46 
 
 
236 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  29.74 
 
 
197 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  33.85 
 
 
222 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  29.45 
 
 
238 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  27.96 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  33.06 
 
 
377 aa  47  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  38.04 
 
 
210 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  38.04 
 
 
210 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.04 
 
 
210 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  30 
 
 
265 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.04 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.04 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30 
 
 
269 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.04 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.04 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.04 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  31.07 
 
 
556 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  31.62 
 
 
377 aa  46.2  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  35.05 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  25.68 
 
 
316 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  28.57 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  38.04 
 
 
233 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  34.78 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  33.33 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  33.33 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  25.37 
 
 
384 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  29.9 
 
 
521 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  33.33 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  30.97 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  33.06 
 
 
260 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  34.88 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  28.97 
 
 
323 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  30.53 
 
 
384 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  25.71 
 
 
324 aa  42.7  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  29.77 
 
 
291 aa  42.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  31.31 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  26.15 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  30.08 
 
 
282 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  30.08 
 
 
267 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  25.39 
 
 
292 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  32 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  27.22 
 
 
272 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  29.46 
 
 
189 aa  42  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  26.09 
 
 
312 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  31.63 
 
 
268 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  33.72 
 
 
269 aa  41.6  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  32.97 
 
 
298 aa  41.6  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>