More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2873 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 314 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  62.24 
 
 		 305 aa  377  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  58.17 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  59.79 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  61.86 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  62.37 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  62.54 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  57.68 
 
 		 302 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  62.54 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  57.72 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  56.7 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  54.3 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  59.03 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  53.82 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  53.42 
 
 		 376 aa  295  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  49.31 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  52.78 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  50.17 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  47.42 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  47.39 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  45.17 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  46.05 
 
 		 304 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  43.46 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  45.55 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  44.88 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  45.91 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  45.64 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  44.09 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  42.27 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  40 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  45.83 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  43.13 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  46.98 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  43.11 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  43.11 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  43.37 
 
 		 295 aa  205  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  43.37 
 
 		 295 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  40.78 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  40.78 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  44.24 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  40.43 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  37.32 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  42.54 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  37.27 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  38.43 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  41.13 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  33.79 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  35.92 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  36.52 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  32.76 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  36.3 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  35.94 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  36.7 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  34.47 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  36.55 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  42.45 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  42.55 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  31.31 
 
 		 332 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  39.1 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  36.69 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  30.85 
 
 		 314 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  35.23 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  42.91 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  34.3 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  34.96 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  37 
 
 		 310 aa  155  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  38.1 
 
 		 481 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  31.54 
 
 		 326 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  32.38 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  31.15 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  31.72 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  36 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  34.51 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  33.21 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  34.06 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  32.85 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  26.86 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  31.2 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  31.2 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  31.2 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  30.43 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  33.6 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  31.25 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3931  cation diffusion facilitator family transporter  31.07 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146752  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  32.7 
 
 		 325 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>