More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2818 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  100 
 
 		 160 aa  313  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 145 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  39.74 
 
 		 158 aa  97.1  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  39.44 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 		 163 aa  92.8  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.22 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 172 aa  87.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  36.97 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  32.24 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  37.09 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  36.81 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  41.35 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  41.35 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 160 aa  84  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 160 aa  84  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 170 aa  84  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 169 aa  84  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  33.75 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  34.25 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 358 aa  80.9  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  34.27 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  37.96 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  28.76 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  28.76 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  29.81 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  35.82 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  40.85 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 227 aa  77.4  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 		 357 aa  77.4  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  34.59 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  36 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>