71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2799 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 
218 aa  447  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  52.34 
 
 
217 aa  228  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  64.05 
 
 
215 aa  207  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  62.5 
 
 
216 aa  193  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  52.8 
 
 
195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  53.85 
 
 
267 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  47.92 
 
 
263 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  42.94 
 
 
270 aa  111  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  35.22 
 
 
207 aa  104  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  37.78 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  37.04 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  30.82 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  40.38 
 
 
262 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  31.43 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  42.17 
 
 
247 aa  59.3  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  38.04 
 
 
253 aa  58.9  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  31.52 
 
 
268 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  36.56 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  31.91 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  37 
 
 
521 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.89 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  37.93 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  35 
 
 
556 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  32.74 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  36.45 
 
 
381 aa  53.1  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  33.58 
 
 
291 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  33.09 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  32.58 
 
 
187 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  37.38 
 
 
377 aa  52.8  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  32.58 
 
 
187 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  33.86 
 
 
412 aa  52  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.88 
 
 
257 aa  52  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  36.94 
 
 
323 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  36.19 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  35.85 
 
 
293 aa  50.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  34.91 
 
 
339 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  35.24 
 
 
377 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  35.23 
 
 
365 aa  49.7  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  34.58 
 
 
189 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.33 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  34.02 
 
 
384 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  34.09 
 
 
337 aa  48.5  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  31.45 
 
 
269 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  29.45 
 
 
312 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  30.65 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  34.33 
 
 
218 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.43 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  39.56 
 
 
269 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  29.53 
 
 
316 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  34.83 
 
 
327 aa  45.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.19 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  29.19 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.35 
 
 
270 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.19 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  29.19 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  31.97 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  32.52 
 
 
294 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  32.99 
 
 
375 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  38.27 
 
 
251 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.81 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  33.64 
 
 
305 aa  43.5  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.57 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  32.37 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.57 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  33.33 
 
 
316 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  35.96 
 
 
291 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.57 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  27.81 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  36.84 
 
 
236 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  32.29 
 
 
210 aa  41.6  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  29.94 
 
 
336 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>