More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2794 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  100 
 
 
181 aa  356  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  45.75 
 
 
180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
183 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
177 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  37.64 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
178 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
186 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 
281 aa  112  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  33.53 
 
 
176 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
166 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
188 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
180 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
184 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
187 aa  104  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
184 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
199 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  34.29 
 
 
185 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
173 aa  101  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 
181 aa  101  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  36.05 
 
 
182 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
169 aa  100  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 
184 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
181 aa  100  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
173 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 
177 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
179 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  38 
 
 
178 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
190 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
201 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  34.78 
 
 
194 aa  97.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
192 aa  97.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
201 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  29.71 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.14 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  31.74 
 
 
176 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  34.81 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  29.55 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  29.55 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
211 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
166 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
203 aa  94  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
180 aa  94  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
180 aa  94  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
179 aa  94  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  29.71 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  32.53 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  31.14 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  35.71 
 
 
192 aa  92.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  33.54 
 
 
171 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  33.53 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
196 aa  90.9  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
181 aa  90.9  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
203 aa  90.9  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  29.28 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  31.58 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
209 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
209 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
209 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  40.61 
 
 
181 aa  89  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  33.14 
 
 
172 aa  88.6  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  33.97 
 
 
210 aa  88.2  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
189 aa  87.8  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>