46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2785 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  100 
 
 		 68 aa  140  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1553  cation transport regulator  55.26 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.203336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1369  cation transport regulator  55.26 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.760537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1907  cation transport regulator  55.26 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1965  cation transport regulator  55.26 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.640932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1901  cation transport regulator  55.26 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.252452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2331  cation transport regulator  55.26 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1848  ChaB family protein  56.76 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0461  putative cation transport regulato, ChaB  53.33 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0020  ChaB family protein  55.22 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2443  ChaB  54.55 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0295  hypothetical protein  52 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.152807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3607  ChaB  48.65 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0044472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1367  cation transport regulator  48 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0817532  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2429  ChaB family protein  48 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2406  cation transport regulator  48 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000158278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1923  cation transport regulator  48 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.41011  normal  0.0497517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1384  cation transport regulator  48 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.886338  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1700  cation transport regulator  48 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.692804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01205  hypothetical protein  48 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01195  cation transport regulator  48 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1325  cation transport regulator  48 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109112  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2071  ChaB  50.67 
 
 		 74 aa  67  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0930  ChaB family protein  50.65 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0349  ChaB  48.65 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4814  ChaB family protein  41.54 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.442759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3951  ChaB family protein  45.45 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0519  ChaB family protein  40.32 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0812  ChaB  38.46 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0379  ChaB family protein  45.83 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303727  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  55.1 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1656  ChaB family protein  49.06 
 
 		 69 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4919  ChaB  47.17 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0756604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2867  hypothetical protein  34.33 
 
 		 255 aa  48.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  42.59 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  44.9 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  39.39 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1077  hypothetical protein  32.2 
 
 		 255 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  42.31 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  42.31 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  42.31 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  42.86 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0942  hypothetical protein  29.85 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.410236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0323  putative cation transport regulator  52.5 
 
 		 56 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.262296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  40.38 
 
 		 139 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  42.86 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>