183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2778 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  100 
 
 
168 aa  342  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  51.88 
 
 
164 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  51.27 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  48.75 
 
 
164 aa  176  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  49.38 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  48.75 
 
 
165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  51.3 
 
 
167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  50.64 
 
 
166 aa  169  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  50.98 
 
 
161 aa  168  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  50.64 
 
 
172 aa  164  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  49.36 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  48.08 
 
 
171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  46.1 
 
 
163 aa  154  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  46.79 
 
 
163 aa  153  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  46.79 
 
 
163 aa  153  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  42.5 
 
 
168 aa  153  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  46.41 
 
 
177 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  45.75 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  45.1 
 
 
171 aa  151  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  43.12 
 
 
160 aa  151  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  40 
 
 
170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  44.87 
 
 
168 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  43.12 
 
 
175 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  47.5 
 
 
164 aa  148  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  43.75 
 
 
175 aa  148  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  44.16 
 
 
169 aa  145  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  44.81 
 
 
174 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  41.56 
 
 
172 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  41.25 
 
 
175 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  39.75 
 
 
163 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  44.24 
 
 
186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  39.38 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  40.91 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  42.95 
 
 
171 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  39.38 
 
 
173 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  45.45 
 
 
165 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  45.51 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  39.74 
 
 
170 aa  134  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  40 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  42.86 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  39.38 
 
 
162 aa  131  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  35.95 
 
 
176 aa  131  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  39.61 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  40.13 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  36.25 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  40.13 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  40.62 
 
 
172 aa  125  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  39.1 
 
 
172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  43.14 
 
 
164 aa  124  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_002950  PG1286  ferritin  39.74 
 
 
160 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  39.74 
 
 
168 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  39.62 
 
 
170 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  38.89 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  40.12 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  40.91 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  39.38 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  39.38 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  38.75 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  39.61 
 
 
477 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  38.12 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  38.75 
 
 
168 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  38.75 
 
 
168 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  38.75 
 
 
168 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  38.75 
 
 
168 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  38.75 
 
 
168 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  38.75 
 
 
168 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  37.5 
 
 
171 aa  115  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  39.38 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15640  ferritin-like protein  37.5 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00614251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  39.62 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17741  Ferritin  39.44 
 
 
177 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.970261 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  36.54 
 
 
171 aa  104  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  33.33 
 
 
178 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1391  Ferritin Dps family protein  36.25 
 
 
169 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0155478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  32.08 
 
 
178 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  32.08 
 
 
178 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  33.56 
 
 
164 aa  101  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  32.08 
 
 
178 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  32.08 
 
 
178 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  32.08 
 
 
178 aa  101  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  32.08 
 
 
178 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  32.08 
 
 
178 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  32.08 
 
 
178 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  33.55 
 
 
175 aa  101  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  32.68 
 
 
174 aa  101  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  32.91 
 
 
165 aa  101  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  33.11 
 
 
172 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  33.33 
 
 
175 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0917  Ferritin Dps family protein  40.15 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  32.68 
 
 
175 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  32.68 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  31.01 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  31.01 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  31.01 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  31.79 
 
 
175 aa  97.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1309  ferritin  31.01 
 
 
165 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000465713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2150  ferritin  31.01 
 
 
165 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.9466e-18 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  32.05 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  29.11 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2124  Ferroxidase  30.82 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>