More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2730 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  100 
 
 		 495 aa  1010    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.92 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  48.57 
 
 		 256 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  38.83 
 
 		 315 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  38.83 
 
 		 315 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  46.35 
 
 		 262 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  40.4 
 
 		 258 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  42.41 
 
 		 258 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.02 
 
 		 251 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.31 
 
 		 233 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  43.27 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  42.51 
 
 		 259 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  42.31 
 
 		 262 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  36.06 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  37.45 
 
 		 318 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.82 
 
 		 249 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.99 
 
 		 256 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  39.71 
 
 		 247 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  40.2 
 
 		 247 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  39.71 
 
 		 247 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2569  cytochrome B561  32.53 
 
 		 280 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  39.49 
 
 		 256 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4815  cytochrome B561  30.92 
 
 		 280 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0865  cytochrome B561  31.23 
 
 		 288 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  38.02 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  38.02 
 
 		 234 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1813  cytochrome B561  31.3 
 
 		 299 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  38.02 
 
 		 234 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  38.01 
 
 		 234 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  35.92 
 
 		 234 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.13 
 
 		 240 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  35.18 
 
 		 255 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2350  hypothetical protein  29.62 
 
 		 280 aa  114  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.772362  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.58 
 
 		 253 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  38.86 
 
 		 255 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  41.61 
 
 		 255 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  41.61 
 
 		 255 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0490  hypothetical protein  28.74 
 
 		 285 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.333881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.83 
 
 		 501 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  35.9 
 
 		 258 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  35.86 
 
 		 258 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3942  hypothetical protein  32.64 
 
 		 265 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.55 
 
 		 261 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  27.17 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2748  hypothetical protein  31.39 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308012  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  36.81 
 
 		 263 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  37.09 
 
 		 241 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  28.06 
 
 		 259 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1009  putative transmembrane b-type cytochrome protein  27.15 
 
 		 287 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154518  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  33.5 
 
 		 249 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4155  hypothetical protein  29.83 
 
 		 242 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187759  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  36.81 
 
 		 258 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 259 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0564  thiosulfate reductase cytochrome B subunit (membrane anchoring protein)-like protein  30.16 
 
 		 280 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0373789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.31 
 
 		 263 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.31 
 
 		 263 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.31 
 
 		 263 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.31 
 
 		 263 aa  97.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.31 
 
 		 263 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.31 
 
 		 263 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.31 
 
 		 263 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3846  hypothetical protein  30.08 
 
 		 242 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.659126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.97 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 259 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.36 
 
 		 263 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.36 
 
 		 263 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  36.42 
 
 		 374 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.79 
 
 		 256 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.55 
 
 		 263 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.36 
 
 		 262 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  36.42 
 
 		 241 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.16 
 
 		 263 aa  94.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 		 259 aa  94.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0019  HupC/HyaC/HydC family protein  30.4 
 
 		 269 aa  94  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  29.67 
 
 		 263 aa  94  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  33.74 
 
 		 263 aa  94  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1039  hypothetical protein  30.8 
 
 		 492 aa  94  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  37.27 
 
 		 215 aa  94  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0016  HupC/HyaC/HydC family protein  30.4 
 
 		 266 aa  94  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  35.37 
 
 		 262 aa  94  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  38.04 
 
 		 258 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 		 259 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  35.62 
 
 		 257 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1578  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.12 
 
 		 297 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0403  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.12 
 
 		 297 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0428  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.12 
 
 		 297 aa  91.7  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.76 
 
 		 322 aa  91.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.17 
 
 		 239 aa  91.3  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  36.23 
 
 		 263 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.69 
 
 		 335 aa  90.5  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3310  putative transmembrane b-type cytochrome protein  27.48 
 
 		 290 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.600987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.81 
 
 		 262 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.81 
 
 		 262 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3633  putative transmembrane b-type cytochrome protein  27.03 
 
 		 290 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.53 
 
 		 332 aa  89.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.8 
 
 		 199 aa  89  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  36.81 
 
 		 262 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0693  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.87 
 
 		 332 aa  89  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  27.17 
 
 		 257 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1075  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.16 
 
 		 297 aa  89  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>