99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2692 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  715    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
389 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  27.25 
 
 
420 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  26.87 
 
 
783 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.93 
 
 
319 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
403 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.6 
 
 
1293 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
383 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
397 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  24.09 
 
 
385 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.98 
 
 
1119 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
416 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  26.03 
 
 
814 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
392 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
398 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  29.45 
 
 
751 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  26.72 
 
 
443 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  25.84 
 
 
783 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  30.24 
 
 
754 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  27.78 
 
 
443 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  27.79 
 
 
741 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  21.56 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
422 aa  95.9  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  25.65 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  25.99 
 
 
405 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  24.72 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
382 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  22.27 
 
 
434 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  28.75 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  24.23 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  31.17 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  27.86 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
705 aa  79.3  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  22.66 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  30.77 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.66 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  30.77 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  24.5 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.1 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  23.64 
 
 
407 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  28.81 
 
 
726 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
729 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  30 
 
 
728 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  30.35 
 
 
728 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.08 
 
 
477 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
388 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 
903 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  26.74 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  20.54 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.03 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  22.03 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
395 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  25.93 
 
 
417 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3120  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
366 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0017817  unclonable  0.0000176244 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  25.1 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  31.03 
 
 
416 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.34 
 
 
723 aa  49.7  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2414  glycosyl transferase group 1 family protein  29.56 
 
 
360 aa  49.3  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  30.91 
 
 
564 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
366 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
367 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  21.58 
 
 
386 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
390 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
380 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  34.06 
 
 
557 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  32.11 
 
 
414 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
904 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  27.57 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0790  glycosyltransferase-like protein  27.06 
 
 
430 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  29.38 
 
 
389 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  30.23 
 
 
388 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3989  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
361 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>