35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2678 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2678  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  583  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1123  hypothetical protein  35.91 
 
 
268 aa  126  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1914  hypothetical protein  52.03 
 
 
252 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0770  hypothetical protein  45.21 
 
 
249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1061  hypothetical protein  47.69 
 
 
199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0851  conserved hypothetical protein  39.24 
 
 
205 aa  106  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1350  hypothetical protein  37.76 
 
 
210 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4691  hypothetical protein  36.54 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0019  O-methyltransferase family protein  35.43 
 
 
229 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2191  hypothetical protein  30.82 
 
 
236 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000770677  hitchhiker  0.000224461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4360  O-methyltransferase family 3  31.11 
 
 
238 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2518  O-methyltransferase-like  30.65 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3499  O-methyltransferase family protein  30.49 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2209  hypothetical protein  26.32 
 
 
272 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.911085  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6910  O-methyltransferase family 3  30.89 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.283882  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2526  O-methyltransferase family 3  31.5 
 
 
217 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4857  O-methyltransferase family protein  30.16 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3394  O-methyltransferase family protein  27.16 
 
 
221 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1960  O-methyltransferase family protein  28.15 
 
 
222 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.467519  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4690  O-methyltransferase family protein  30.16 
 
 
219 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0886  O-methyltransferase family 3  28.23 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0398072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2932  O-methyltransferase family 3  26.87 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0268348  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0913  O-methyltransferase  28.91 
 
 
221 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1235  hypothetical protein  32.8 
 
 
286 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.1753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3032  hypothetical protein  27.56 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1443  hypothetical protein  28.86 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4853  O-methyltransferase family protein  31.45 
 
 
220 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3352  hypothetical protein  33.59 
 
 
211 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5416  O-methyltransferase family protein  30.65 
 
 
221 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00312327 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5446  O-methyltransferase family protein  30.65 
 
 
221 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0236  O-methyltransferase family protein  30.65 
 
 
221 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0962  O-methyltransferase family protein  30.23 
 
 
223 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3938  hypothetical protein  29.55 
 
 
221 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2360  hypothetical protein  29.41 
 
 
247 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.699559  normal  0.535818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3183  putative O-methyltransferase  28 
 
 
220 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>