More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2676 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  61.81 
 
 
235 aa  268  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  59.02 
 
 
217 aa  257  9e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  56.93 
 
 
218 aa  249  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  56.65 
 
 
225 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  56.67 
 
 
228 aa  244  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  57.28 
 
 
227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  58 
 
 
230 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  57.42 
 
 
228 aa  241  7.999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  59.5 
 
 
227 aa  240  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  56.38 
 
 
213 aa  239  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  56.44 
 
 
218 aa  239  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  55.94 
 
 
210 aa  238  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.71 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  59.41 
 
 
227 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  55.78 
 
 
220 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  55.78 
 
 
220 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  59.69 
 
 
246 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  55.5 
 
 
221 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  60.42 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  55.78 
 
 
223 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  59.07 
 
 
238 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  57.29 
 
 
227 aa  229  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  52.71 
 
 
212 aa  228  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  60.71 
 
 
239 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  52.22 
 
 
222 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.58 
 
 
241 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.27 
 
 
217 aa  226  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.41 
 
 
263 aa  224  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  57.36 
 
 
245 aa  224  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  59.9 
 
 
256 aa  223  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  54.41 
 
 
286 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  56.72 
 
 
234 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.27 
 
 
278 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  55.1 
 
 
276 aa  222  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  56.77 
 
 
248 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.49 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  51.27 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  55.84 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  53.73 
 
 
284 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  53.3 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  56.63 
 
 
248 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  54.95 
 
 
216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  56.63 
 
 
260 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  55.1 
 
 
270 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  52.28 
 
 
213 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  56.12 
 
 
256 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  55.61 
 
 
258 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  49.03 
 
 
215 aa  213  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  50.75 
 
 
208 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  51.01 
 
 
219 aa  213  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  54.4 
 
 
223 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  48.51 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  52.71 
 
 
285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  53.81 
 
 
209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.29 
 
 
226 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  51.72 
 
 
219 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  55.61 
 
 
259 aa  211  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  54.31 
 
 
259 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  54.31 
 
 
259 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  53.57 
 
 
220 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  53.3 
 
 
209 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  50.74 
 
 
251 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.81 
 
 
259 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  54.5 
 
 
223 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  53.89 
 
 
276 aa  208  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  55.73 
 
 
241 aa  208  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  46.97 
 
 
209 aa  208  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  54.64 
 
 
246 aa  207  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.53 
 
 
228 aa  207  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  52.91 
 
 
226 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  50.98 
 
 
281 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  52.28 
 
 
207 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  56.12 
 
 
228 aa  205  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  51.01 
 
 
228 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  49.26 
 
 
229 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  52.91 
 
 
215 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  52.91 
 
 
215 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  52.91 
 
 
215 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  52.91 
 
 
215 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  52.91 
 
 
215 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  52.91 
 
 
215 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1071  endonuclease III  54.08 
 
 
245 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  47.83 
 
 
211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  53.06 
 
 
268 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  51.81 
 
 
215 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  53.85 
 
 
244 aa  199  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  51.85 
 
 
215 aa  198  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  52.91 
 
 
215 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.16 
 
 
178 aa  197  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  51.85 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  52.74 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  53.27 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.52 
 
 
277 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  51.32 
 
 
215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  51.23 
 
 
230 aa  194  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  50.51 
 
 
224 aa  194  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  50.74 
 
 
230 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  51.5 
 
 
235 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  48.29 
 
 
212 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>