74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2621 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  297  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  40.79 
 
 
167 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  37.25 
 
 
158 aa  100  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  38.82 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  38.06 
 
 
257 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  38.82 
 
 
251 aa  90.1  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  38.56 
 
 
251 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  39.61 
 
 
254 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  38.06 
 
 
251 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  36.77 
 
 
258 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  36.77 
 
 
258 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  38.62 
 
 
251 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  38.56 
 
 
253 aa  87  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  38.46 
 
 
247 aa  84.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  40 
 
 
262 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  39.46 
 
 
252 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  36.3 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  34.03 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  39.34 
 
 
261 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  36.42 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  34.25 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  36.11 
 
 
252 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  40.69 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  34.42 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  41.78 
 
 
268 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  33.79 
 
 
247 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  33.79 
 
 
247 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  41.78 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  35.66 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  35.33 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  41.78 
 
 
246 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  36.84 
 
 
243 aa  77.4  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  35.46 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  40 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  40 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0441  protein of unknown function DUF82  37.43 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  37.18 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  34.44 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  33.78 
 
 
251 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0747  hypothetical protein  34.64 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  33.99 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  32.88 
 
 
267 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  36.3 
 
 
252 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  38.89 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  31.47 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2635  protein of unknown function DUF82  34.97 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  33.99 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3160  hypothetical protein  38.85 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1135  protein of unknown function DUF82  33.14 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  26.32 
 
 
261 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  25.66 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  32.24 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  28.75 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1167  hypothetical protein  35.92 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  26.03 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1020  hypothetical protein  32 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.134843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7452  protein of unknown function DUF82  37.06 
 
 
262 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0100  protein of unknown function DUF82  37.5 
 
 
235 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.566034  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  28.29 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  34.51 
 
 
268 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0219  protein of unknown function DUF82  39.61 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375339  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48873  predicted protein  28.39 
 
 
808 aa  50.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424343  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1591  hypothetical protein  31.69 
 
 
162 aa  45.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1691  hypothetical protein  31.91 
 
 
193 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000104629  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  28.1 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1354  hypothetical protein  36.17 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.002337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2642  hypothetical protein  36 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1779  hypothetical protein  31.69 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000347212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2515  hypothetical protein  37.04 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172015  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0508  hypothetical protein  36.07 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0988512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>