27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2615 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2615  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  208  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1978  hypothetical protein  56.31 
 
 		 218 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.628499  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2648  beta-lactamase domain protein  48 
 
 		 219 aa  87.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  38.83 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  41.43 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1248  hypothetical protein  39.44 
 
 		 215 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0560994  decreased coverage  0.00000150811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  37.84 
 
 		 275 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  42.25 
 
 		 213 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0110  metallo-beta-lactamase superfamily protein  48.48 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  43.55 
 
 		 328 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  39.47 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5553  hypothetical protein  36.76 
 
 		 215 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  50 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  32.97 
 
 		 230 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 275 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  38.67 
 
 		 319 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  40.28 
 
 		 211 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  38.67 
 
 		 319 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 370 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2738  hypothetical protein  39.13 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526378  normal  0.0730468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2752  hypothetical protein  39.13 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2708  hypothetical protein  39.13 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.463816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  42.67 
 
 		 211 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>