More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2588 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  100 
 
 
378 aa  720    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  37.99 
 
 
409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  34.96 
 
 
404 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  39.25 
 
 
402 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  34.04 
 
 
419 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  32.86 
 
 
414 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  30.71 
 
 
407 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  35.01 
 
 
403 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  33.9 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  31.69 
 
 
414 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  31.69 
 
 
414 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  30.61 
 
 
415 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  32.73 
 
 
421 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  32.39 
 
 
420 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  32.09 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  36.39 
 
 
422 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  30.03 
 
 
415 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  32.91 
 
 
421 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  30.53 
 
 
408 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  31.9 
 
 
420 aa  166  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  32.77 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  31 
 
 
394 aa  166  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  30.95 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  34.83 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  31.9 
 
 
420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  34.1 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  35.29 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  32.71 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  34.15 
 
 
420 aa  163  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  32.11 
 
 
403 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  32.49 
 
 
404 aa  162  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  30.97 
 
 
404 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  33.6 
 
 
406 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  31.31 
 
 
405 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  32.71 
 
 
419 aa  160  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  29.44 
 
 
406 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  38.25 
 
 
417 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  33.12 
 
 
421 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  35.28 
 
 
427 aa  157  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  32.62 
 
 
404 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  34.97 
 
 
417 aa  155  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  28.82 
 
 
447 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  30.4 
 
 
420 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  36.12 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
400 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  27.39 
 
 
400 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  28.57 
 
 
418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  31.06 
 
 
422 aa  146  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  30.09 
 
 
460 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  29.14 
 
 
424 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  30 
 
 
429 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 
360 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  32.02 
 
 
388 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  31.49 
 
 
404 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  33.97 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  31.09 
 
 
367 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  32.55 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  30.93 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  29.97 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  29.9 
 
 
370 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  30.1 
 
 
319 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  32.1 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  27.24 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  30.74 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  32.37 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  29.19 
 
 
319 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  32.92 
 
 
342 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0528  6-phosphofructokinase  29.77 
 
 
319 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4709  6-phosphofructokinase  29.77 
 
 
319 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  30.85 
 
 
348 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  30.87 
 
 
340 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  30.72 
 
 
341 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  31.87 
 
 
341 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  30.74 
 
 
341 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4730  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
319 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4493  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
319 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4328  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
319 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4340  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
319 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4714  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
319 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.177763 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4844  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
319 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  31.08 
 
 
344 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  32.92 
 
 
342 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4725  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
319 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4429  6-phosphofructokinase  29.43 
 
 
319 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  30.7 
 
 
345 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  29.17 
 
 
336 aa  107  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  28.22 
 
 
341 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  30.46 
 
 
341 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002222  6-phosphofructokinase  28 
 
 
320 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0278288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00145  6-phosphofructokinase  28.28 
 
 
320 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  28.86 
 
 
319 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  28.16 
 
 
368 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  29.87 
 
 
319 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  29.87 
 
 
319 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 
342 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  30.96 
 
 
341 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  28.43 
 
 
322 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  33.94 
 
 
343 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0138  6-phosphofructokinase  25.81 
 
 
320 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  31.74 
 
 
342 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>