85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2573 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2573  calcium/proton exchanger  100 
 
 
331 aa  625  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.144638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  45.17 
 
 
370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1369  calcium/proton antiporter, CaCA family  51.07 
 
 
354 aa  272  6e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1624  calcium/proton exchanger  46.2 
 
 
348 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000062591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  48.52 
 
 
360 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3705  H+/Ca2+ exchanging protein  43.24 
 
 
354 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1366  calcium/proton exchanger  46.2 
 
 
348 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.609235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3782  calcium/cation antiporter  47.28 
 
 
374 aa  248  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.133642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2549  calcium/proton antiporter, CaCA family  44.48 
 
 
365 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3557  calcium/proton antiporter, CaCA family  44.48 
 
 
365 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3626  calcium/cation antiporter  42.12 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.319673 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0023  calcium/proton exchanger  44.61 
 
 
354 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.662707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4558  calcium/proton exchanger  44.51 
 
 
363 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0486  calcium/proton antiporter, CaCA family  48.39 
 
 
358 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.18293  normal  0.526357 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  38.07 
 
 
416 aa  230  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2439  CaCA family calcium/proton antiporter  42.9 
 
 
364 aa  229  7e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.219507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  42.39 
 
 
354 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  42.39 
 
 
354 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0399  calcium/cation antiporter  42.39 
 
 
351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  42.39 
 
 
354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  42.39 
 
 
354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  42.39 
 
 
351 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  42.39 
 
 
351 aa  225  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  42.39 
 
 
351 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0422  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.96 
 
 
350 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00187889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5035  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.33 
 
 
367 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3001  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.47 
 
 
358 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  42.09 
 
 
354 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0405  calcium/cation antiporter  42.17 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21390  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.26 
 
 
349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1870  calcium/proton antiporter, CaCA family  42.68 
 
 
351 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0927  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.27 
 
 
363 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4839  calcium/proton exchanger  41.27 
 
 
351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1302  calcium/proton antiporter, CaCA family  41.57 
 
 
350 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1655  calcium/proton antiporter, CaCA family  43.79 
 
 
379 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1779  calcium/proton antiporter, CaCA family  40.83 
 
 
356 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  0.740708 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0904  calcium/proton antiporter, CaCA family  46.9 
 
 
356 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0458439  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  39.58 
 
 
370 aa  206  6e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00471  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  36.99 
 
 
434 aa  205  9e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463477  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11387  predicted protein  36.73 
 
 
348 aa  189  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3000  calcium/proton antiporter, CaCA family  37.28 
 
 
366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.555455  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1907  calcium/proton exchanger  38.99 
 
 
361 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  37.28 
 
 
367 aa  172  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07510  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  32.78 
 
 
544 aa  170  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.640031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  39.94 
 
 
364 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5192  calcium/cation antiporter  38.3 
 
 
381 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.666096 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2427  calcium/proton exchanger  40.29 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_2762  predicted protein  30.72 
 
 
324 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.520471  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02980  calcium:hydrogen antiporter, putative  34.57 
 
 
403 aa  152  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.696146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1240  sodium/calcium exchanger membrane region  35.14 
 
 
365 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228892 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07173  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  43.1 
 
 
742 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000380184  normal  0.53432 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00180  calcium ion transporter, putative  38 
 
 
599 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0287114  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05821  Vacuolar Ca(2+)/H(+) exchanger, putative (Eurofung)  28.53 
 
 
481 aa  99.4  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.784343  normal  0.652045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1975  sodium/calcium exchanger membrane region  49.39 
 
 
189 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00510544  normal  0.677421 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01330  calcium ion transporter, putative  37.14 
 
 
689 aa  95.9  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.712478  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05500  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 
1344 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06986  calcium/ hydrogen exchanger, putative (Eurofung)  29.31 
 
 
1129 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53985  Ca2+/H+ antiporter  28.14 
 
 
967 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0314274  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  28.03 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  25.19 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  28.29 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  28.05 
 
 
361 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  28.05 
 
 
361 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  28.05 
 
 
361 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  28.05 
 
 
361 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  27.57 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  27.57 
 
 
361 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  24.62 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  27.57 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  28.29 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  29.63 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  28.29 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  28.63 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  27.89 
 
 
362 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  27.49 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  27.49 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  27.05 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  27.31 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  26 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  27.69 
 
 
360 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  27.49 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  28.75 
 
 
365 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  25.97 
 
 
382 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  22.27 
 
 
363 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  27.82 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>