77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2542 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 270 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  49.29 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  49.29 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  42.94 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  42.41 
 
 		 216 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1137  peptidase C60, sortase A and B  51.4 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  51.28 
 
 		 195 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  40.29 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  39.46 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.8 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  38.28 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  36.07 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  39.2 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  35.25 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  31.15 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  35.25 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  38.02 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  30.08 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  38.53 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  35.33 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  31.43 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  32.56 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  33.61 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  35.25 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  37.5 
 
 		 556 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  33.61 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  34.11 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  31.3 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  34.43 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  31.01 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  25.93 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  30.71 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  30.71 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  32.79 
 
 		 395 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  34.68 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  30.94 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  31.45 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  32.37 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  29.84 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.15 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.15 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  31.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  31.15 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.15 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.07 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  31.45 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  34.07 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  30.65 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  31.45 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  34.43 
 
 		 316 aa  52.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  31.87 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  31.15 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  31.45 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  25 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  32.26 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  33.9 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  38.64 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  32.79 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  32.58 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  31.45 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  37.36 
 
 		 350 aa  48.9  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.04 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  35.45 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  35.04 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  36.44 
 
 		 323 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  38.68 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  30.33 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  32.97 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  29.89 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  25.51 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  25.51 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  34.41 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2491  sortase family protein  29.29 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0534452  normal  0.504186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  30.99 
 
 		 308 aa  43.5  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  33.03 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  29.09 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>