More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2510 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
640 aa  1254    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  33.98 
 
 
830 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.53 
 
 
1301 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
1363 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  59.15 
 
 
820 aa  180  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.18 
 
 
1333 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  59.15 
 
 
1267 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2350  putative PAS/PAC sensor protein  35.44 
 
 
450 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  43.67 
 
 
394 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.9 
 
 
904 aa  172  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  44.1 
 
 
394 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.31 
 
 
1358 aa  166  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.38 
 
 
906 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4182  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.42 
 
 
1369 aa  163  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2071  hypothetical protein  44.51 
 
 
512 aa  160  8e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.12 
 
 
510 aa  160  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2061  hypothetical protein  53.08 
 
 
512 aa  157  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  50.32 
 
 
1079 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1557 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2360  putative sensor protein  46.54 
 
 
1105 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1165  putative sensor protein  46.54 
 
 
1105 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.807956  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01973  predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein  46.54 
 
 
1105 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0993  putative sensor protein  46.54 
 
 
1105 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.7374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01962  hypothetical protein  46.54 
 
 
1105 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.86 
 
 
518 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.315276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.91 
 
 
1105 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.131154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1574  putative sensor protein  45.91 
 
 
1105 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115387  normal  0.924629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
779 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02522  putative diguanylate cyclase/phosphodiesterase (GGDEF & EAL domains) with PAS/PAC sensor(s) and Response Regulator  55.38 
 
 
427 aa  153  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.43 
 
 
1959 aa  153  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
401 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
399 aa  151  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2681  putative sensor protein  47.1 
 
 
1117 aa  150  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.62 
 
 
839 aa  150  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.17 
 
 
624 aa  150  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  50 
 
 
3706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4702  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  52.94 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.781083  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  40 
 
 
489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
473 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
1291 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  42.52 
 
 
309 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  43.4 
 
 
762 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
1262 aa  141  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
658 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
1093 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
1093 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  40.97 
 
 
361 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2358  mase1 domain family  42.95 
 
 
998 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.922212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2251  PAS domain protein  42.95 
 
 
998 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2307  mase1 domain family  42.95 
 
 
998 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2351  mase1 domain family protein  42.28 
 
 
998 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.659224  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 
919 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
662 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  33.04 
 
 
525 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
725 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 
396 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  43.62 
 
 
1258 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  27.18 
 
 
1101 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  37.72 
 
 
662 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1206  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.89 
 
 
609 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.6 
 
 
640 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  34.46 
 
 
482 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2666  putative sensor protein  48.34 
 
 
1129 aa  134  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2209  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.39 
 
 
844 aa  134  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2759  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 
591 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.612299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2664  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
590 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  51.11 
 
 
1047 aa  132  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.61 
 
 
916 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  51.11 
 
 
1047 aa  132  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.591711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
545 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  42.11 
 
 
282 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2409  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.82 
 
 
729 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.798311  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  38.26 
 
 
497 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
561 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
650 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  46.98 
 
 
821 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  46.04 
 
 
874 aa  130  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  36.07 
 
 
373 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2192  XRE family transcriptional regulator  46.58 
 
 
359 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0311386  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
359 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0591  putative sensor protein  47.68 
 
 
1121 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
477 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
1439 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  35.32 
 
 
585 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  27.51 
 
 
1226 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
535 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
1229 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
521 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
544 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
599 aa  127  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
1516 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
1075 aa  127  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
700 aa  127  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1099 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
421 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>