69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2378 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2378  beta-lactamase-like protein  100 
 
 
271 aa  564  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1494  beta-lactamase domain protein  37.01 
 
 
282 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00424723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  37.01 
 
 
283 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  37.18 
 
 
266 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0540  beta-lactamase-like protein  33.58 
 
 
273 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2721  beta-lactamase domain protein  34.7 
 
 
268 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.91537  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07316  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 
294 aa  118  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000551538  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2373  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 
269 aa  118  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0752798  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09027  conserved hypothetical protein  30.66 
 
 
279 aa  112  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  31.39 
 
 
253 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1316  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
263 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  28.97 
 
 
250 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 
262 aa  89  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  29.51 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  30.1 
 
 
250 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  30.1 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  30.1 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  30.1 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30.1 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  30.1 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  29.59 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  29.59 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  25.52 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1580  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1848  beta-lactamase-like protein  29.69 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1829  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1895  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142767  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3043  beta-lactamase-like protein  26.29 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1654  Zn-dependent hydrolase  23.05 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002733  GumP protein  24.9 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672439  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  22.49 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3485  AHL-lactonase  30.53 
 
 
94 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  24.57 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0903  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 
235 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  26.13 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18590  metallo-beta-lactamase superfamily enzyme  24.45 
 
 
282 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03884  hypothetical protein  31.11 
 
 
136 aa  52  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.762573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  22.93 
 
 
308 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0171  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1599  hypothetical protein  25.21 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4708  beta-lactamase domain-containing protein  24.12 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  25.63 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  24.42 
 
 
248 aa  49.3  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  32.03 
 
 
284 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  24.77 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  25.24 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  24.34 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  24.86 
 
 
263 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0714  hypothetical protein  23.53 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  24.26 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3247  hypothetical protein  25 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3015  hypothetical protein  25.51 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  25.77 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  27.48 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  25.83 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2956  beta-lactamase domain-containing protein  22.49 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0379847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  25.25 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0941  beta-lactamase domain-containing protein  46.34 
 
 
185 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  27.37 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02639  conserved hypothetical protein  25.41 
 
 
365 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  29.85 
 
 
282 aa  42.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0375  beta-lactamase domain-containing protein  21.71 
 
 
176 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.397371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  28.37 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>