More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2344 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  897    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  56.51 
 
 		 450 aa  491  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  57.55 
 
 		 433 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  55.98 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.77 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  52.62 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  52.26 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  55.51 
 
 		 452 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  51.6 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  50.35 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  52.42 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  53.55 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  46.95 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  52.39 
 
 		 442 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  50.57 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  49.5 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  51.16 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  50.45 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  50.7 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  50.24 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  49.54 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  50.79 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  47.96 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  52.15 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  52.71 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.06 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.33 
 
 		 437 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  45.25 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  45.25 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  47.72 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  46.01 
 
 		 456 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  46.71 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  45.25 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  50.82 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  48.08 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  45.48 
 
 		 484 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  45.45 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  45.75 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 445 aa  362  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 454 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  45.98 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  48.57 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  47.36 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3351  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 		 444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0813627  normal  0.0585989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  43.81 
 
 		 482 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 437 aa  353  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  42.7 
 
 		 459 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 439 aa  353  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  47.48 
 
 		 439 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  46.89 
 
 		 465 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 457 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  46.57 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  46.68 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  46.52 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  46.52 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 441 aa  350  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0408  major facilitator superfamily MFS_1  46.71 
 
 		 464 aa  349  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 		 435 aa  349  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 458 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  46.52 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3956  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00119872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  48.26 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  47.67 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 		 452 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  47.43 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  46.28 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  46.28 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  45.8 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  45.86 
 
 		 439 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 460 aa  345  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  45.09 
 
 		 463 aa  345  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.94 
 
 		 452 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  44.39 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  44.16 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  46.21 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  46.85 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  43.46 
 
 		 438 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4212  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 		 458 aa  342  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>