More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2334 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  40.48 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  39.32 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.71 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  32.35 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  33.86 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  35.92 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  35.92 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  35.48 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  32.23 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  37.82 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  32.9 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  33.98 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  36.61 
 
 		 193 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0327  hypothetical protein  36.73 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000150784  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  33.63 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  35.65 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  38.68 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.78 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33.61 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.78 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  30.17 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  32.77 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  33.01 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  32.87 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.91 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.07 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  29.31 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32.77 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32.77 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32.77 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32.77 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32.77 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32.77 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  41.05 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  32.62 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32.77 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  28.93 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  27.91 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  33.33 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.93 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  30.17 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.06 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  32.11 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.11 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0110  phenylacetic acid degradation-related protein  32.41 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>