248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2316 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  100 
 
 
179 aa  359  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.4 
 
 
180 aa  186  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  47.75 
 
 
178 aa  180  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  50.55 
 
 
180 aa  173  9e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  49.44 
 
 
178 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  45.3 
 
 
181 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  45.3 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.62 
 
 
192 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  44.13 
 
 
183 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  47.46 
 
 
181 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.62 
 
 
201 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  44.56 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  46.41 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.52 
 
 
221 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.01 
 
 
221 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
217 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  40.1 
 
 
228 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.71 
 
 
221 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  40.53 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.67 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.74 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  40.68 
 
 
178 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  41.76 
 
 
199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  40 
 
 
204 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
204 aa  127  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  42.22 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.01 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  38.76 
 
 
179 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.62 
 
 
212 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  36.98 
 
 
219 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.33 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.88 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.63 
 
 
200 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.71 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.1 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.82 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.83 
 
 
203 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  38.12 
 
 
183 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.76 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  41.21 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.44 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.49 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
188 aa  111  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  42.19 
 
 
187 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  39.06 
 
 
218 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.94 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.66 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.2 
 
 
201 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
187 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
181 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.42 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  39.52 
 
 
187 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  39.57 
 
 
205 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
203 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.78 
 
 
204 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.92 
 
 
197 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.72 
 
 
178 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.6 
 
 
199 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.15 
 
 
190 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.22 
 
 
187 aa  104  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.41 
 
 
224 aa  104  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  39.58 
 
 
192 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  37.37 
 
 
200 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  36.41 
 
 
208 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  35.79 
 
 
199 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3142  deaminase-reductase domain-containing protein  36.73 
 
 
192 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.921485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  36.65 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  39.25 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.26 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.954873  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.15 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4631  deaminase-reductase domain-containing protein  36.27 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.98 
 
 
217 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  41.98 
 
 
217 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  37.25 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  42.33 
 
 
217 aa  97.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.96 
 
 
209 aa  97.8  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.16 
 
 
177 aa  97.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
209 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  37.65 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 
200 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  37.2 
 
 
221 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  30.11 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2027  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 
221 aa  95.5  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  31.72 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.71 
 
 
188 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3213  putative secreted protein  48.96 
 
 
98 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.82639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.57 
 
 
202 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05750  dihydrofolate reductase  36.92 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  36.87 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2627  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.2 
 
 
194 aa  91.7  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299497  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.71 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.3 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.13 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>