More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2309 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  100 
 
 		 287 aa  555  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  36 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  39.34 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  43.1 
 
 		 374 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  34.94 
 
 		 395 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  31.92 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  34.62 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  40.13 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  38.23 
 
 		 367 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  34.94 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  32.15 
 
 		 404 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  35.87 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1586  putative L-cysteine/cystine lyase  34.29 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  33.56 
 
 		 368 aa  144  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  34.52 
 
 		 393 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  31.29 
 
 		 376 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  34.49 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  35.53 
 
 		 380 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  37.54 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0791  putative L-cysteine/cystine lyase  34.41 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51384  normal  0.0724988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  36.39 
 
 		 381 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  33.12 
 
 		 394 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21101  putative L-cysteine/cystine lyase  32.18 
 
 		 428 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  35.05 
 
 		 411 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  36.56 
 
 		 383 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  30.25 
 
 		 380 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04121  putative L-cysteine/cystine lyase  30.22 
 
 		 391 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0272358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  33.12 
 
 		 392 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  35.02 
 
 		 380 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  32.17 
 
 		 393 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  35.2 
 
 		 880 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  33.75 
 
 		 382 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  33.87 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  29.75 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  30.5 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1748  putative L-cysteine/cystine lyase  30.32 
 
 		 400 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.701457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  30.07 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  35.46 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  28.39 
 
 		 378 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  29.07 
 
 		 380 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  33.22 
 
 		 381 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1763  class V aminotransferase  30.19 
 
 		 381 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.73 
 
 		 412 aa  116  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0410  putative L-cysteine/cystine lyase  26.13 
 
 		 391 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.33409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  31.01 
 
 		 381 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04651  putative L-cysteine/cystine lyase  26.77 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.283231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  25.81 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  34.37 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  26.37 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 422 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  29 
 
 		 379 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  32.19 
 
 		 380 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  33.65 
 
 		 380 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  32.99 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.87 
 
 		 406 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  27.42 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1876  cysteine desulfurase family protein  27.16 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  31.27 
 
 		 387 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  32.31 
 
 		 385 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.54 
 
 		 406 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.48 
 
 		 418 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1403  cysteine desulphurase-like protein  35.67 
 
 		 383 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  29.1 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  28.27 
 
 		 461 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  30 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  33.76 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.28 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 878 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  28.94 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.03 
 
 		 412 aa  106  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  26.09 
 
 		 386 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  31.75 
 
 		 879 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.62 
 
 		 409 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  27.66 
 
 		 476 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  25.78 
 
 		 386 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.57 
 
 		 885 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.75 
 
 		 415 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.38 
 
 		 408 aa  105  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  27.27 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  42.18 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.35 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.38 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  31.97 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.84 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.48 
 
 		 608 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0881  aminotransferase, class V  30.99 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0070311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  29.8 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  29.28 
 
 		 377 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  30.72 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 626 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2209  aminotransferase, class V  27.39 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159851  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  27.44 
 
 		 469 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  31.83 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.92 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  28.45 
 
 		 462 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  28.75 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.71 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  30.23 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  30.13 
 
 		 422 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.73 
 
 		 407 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>