291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2297 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2297  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 319 aa  637    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  41.9 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  34.98 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.65 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.83 
 
 		 310 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.71 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.16 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  32.58 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  29.81 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  30.55 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.29 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  31.03 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  31.03 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  31.61 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0182  ribokinase-like domain-containing protein  28.76 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  32.35 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.9 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0099  ribokinase-like domain-containing protein  32.31 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  30.84 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.17 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  30.19 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  31.68 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  32.03 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  29.9 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  30.52 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.99 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.2 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  31.85 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.53 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.65 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  32.18 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  33.33 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0099  ribokinase-like domain-containing protein  32.47 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  32.68 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  32.59 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  36.03 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.2 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  32.32 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  29.62 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  33 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  32.56 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  31.14 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  31.76 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0676  ribokinase-like domain-containing protein  28.47 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5797  PfkB domain protein  35.44 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  27.65 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  31.14 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  29.06 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5907  1-phosphofructokinase  38.38 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686402  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  31.87 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  28.1 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  30.33 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  30.33 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  31.41 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  30.42 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  30.61 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  30.04 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  31.58 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  30.83 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  30.83 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  30.83 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  30.83 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  30.83 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  30.83 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  30.83 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  30.83 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  29.35 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  32.84 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  29.43 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  31.94 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.43 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  33.23 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  26.56 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  30.24 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  34.33 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  31.39 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  32.76 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>